| Processo: | 00/12107-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2001 |
| Data de Término da vigência: | 31 de maio de 2005 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular |
| Pesquisador responsável: | Antonio Caliri |
| Beneficiário: | Luiz Faustino de Oliveira Rocha |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Proteínas |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Folding De Macromoleculas | Forca Entropica | Proteinas |
Resumo Neste projeto propomos estudar o processo de folding de proteínas através da simulação Monte Cario envolvendo múltiplas escalas espaciais/temporais. Serão consideradas cadeias peptídicas pequenas, tanto por sua crescente importância atual quanto por conveniência computacional. Os principais ingredientes considerados no processo são classificados em dois grupos principais: (i)- força entrópica (efeito hidrofóbico) e especificidades estéricas (complementaridade dos resíduos) e (ii)- especificidades químicas (pontes de hidrogênio, pontes salinas e links covalentes). Um programa computacional original deverá ser planejado e codificado para este propósito. Concomitantemente serão desenvolvidos algoritmos computacionais, envolvendo desde o conjunto de movimentos básicos (moves set) em diferentes escalas: monômeros (da estrutura primária) e grupamentos de monômeros (motifes: a-hélices, b - strands, turns, etc.). Este procedimento exigirá o envolvimento de diferentes escalas temporais e espaciais ao longo da simulação que deverão levar em conta o fato de as estruturas secundárias se formarem numa escala de tempo muito menor (10-6 segundos) do que as estruturas terciárias (10?2 - 10?3 segundos). (AU) | |
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