Folding espontaneo de macromoleculas: o colapso hidrofobico e as interacoes estericas.

• Processo: 98/02405-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 1998
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2001
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Antonio Caliri
• Beneficiário: Antonio Caliri
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Método de Monte Carlo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Colapso Hidrofobico | Folding Reverso | Forcas Entropicas | Interacoes Estericas | Monte Carlo

Resumo

Estudamos o papel singular das "forças entrópicas" (efeito hidrofóbico) e das interações estéricas no mecanismo de "folding". O modelo, a ser tratado por simulação Monte Carlo, incorpora, interações cadeia-cadeia, cadeia-solvente e solvente-solvente. Hidrofobicidade é introduzido no método Monte Carlo através da "minimização da superfície acessível". Conjectura-se/propõe-se elucidar que: 1) uma composição peculiar do efeito hidrofóbico e das interações estéricas constitue-se no ingrediente primários do processo de folding; 2) interações intramoleculares não-covalentes e cross links covalentes proporcionam a especificidade interacional necessária para a identificação inequívoca da conformação nativa. (AU)