"folding" deterministico de macromoleculas.

• Processo: 98/00437-8
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de abril de 1998
• Vigência (Término): 30 de novembro de 2001
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Antonio Caliri
• Beneficiário: Roosevelt Alves da Silva
• Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Método de Monte Carlo Macromolécula

Resumo

Este projeto visa contribuir para o entendimento do papel das interações hidrofóbicas (forças entrópicas) e das interações estéricas (interações do tipo "hardcore") no mecanismo do folding, o qual consiste em prever a conformação tridimensional de uma macromolécula a partir da informação da seqüência dos monomeros que a constitue. Também o assim chamado "problema reverso para o folding" será tratado: dada uma estrutura alvo, definida formalmente pelas coordenadas R{r1, r2, ...}, qual é a melhor seqüência S para se obter aquela estrutura? Este problema é de grande importância na área da biotecnologia, particularmente para a indústria farmacêutica, pois a geração de novos conhecimentos nesta direção pode certamente facilitar na tarefa do "design" de novas drogas. Também é nosso objetivo caracterizar o papel das interações atrativas não covalentes nessa nova visão (as ligações tipo "croos-link" terão atenção especial), quanto à sua especificidade na determinação da conformação nativa. (AU)