Gerenciamento e análise de dados de microarrays de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico do câncer de próstata humano

• Processo: 03/05185-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Aline Maria da Silva
• Beneficiário: Ana Carolina Quirino Simoes
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/07390-0 - Cooperation for Analysis of Gene Expression - CAGE, AP.TEM
• Assunto(s): Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Biomarcadores Neoplasias da próstata Biologia computacional Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco De Dados | Bioinformatica | Expressao Genica | Microarrays De Dna

Resumo

Os microarrays de DNA são considerados hoje a melhor alternativa para análise quantitativa dos níveis de expressão de milhares de genes simultaneamente, permitindo com relativa facilidade a avaliação global da expressão gênica em organismos, tecidos ou células, em diferentes situações fisiológicas ou patológicas. Através desta tecnologia, o perfil de expressão de milhares de genes foi comparado em diversos tipos de câncer, permitindo avanços significativos na identificação e classificação de subtipos tumorais, na descoberta de biomarcadores de valor diagnóstico e prognóstico da doença e também na compreensão da biologia do câncer. Através do projeto temático CAGE em andamento e de um outro projeto temático em fase de julgamento na FAPESP, nosso grupo tem como objetivo a busca e identificação de genes candidatos a biomarcadores para o diagnóstico e prognóstico do câncer de próstata, a partir de dados experimentais dos níveis de expressão de milhares de genes obtidos através de microarrays de DNA. Para dar suporte a este objetivo propomos, neste projeto de doutorado, estruturar, configurar e implementar um banco de dados relacional e associar ferramentas estatísticas apropriadas para análise de dados de microarrays de DNA que estão sendo gerados em nosso grupo. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SIMOES, Ana Carolina Quirino. Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos. 2009. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI) São Paulo.