Identificação de genes de Xylella fastidiosa (Xf) com expressão regulada por concentrações subinibitorias de peptídeos antimicrobianos

• Processo: 04/02763-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2004
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Aline Maria da Silva
• Beneficiário: Patricia Isabela Pessoa da Silva
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Xylella fastidiosa Expressão gênica Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Clorose variegada dos citros Biologia computacional Genética molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformatica | Expressao Genica | Genomica Funcional | Microarrays De Dna

Resumo

Xylella fastidiosa (Xf) é o fitopatógeno causador da clorose variegada dos citros (CVC), sendo responsável por prejuízos ao cultivo de laranjas doces no Brasil. Como não existe uma forma direta de combate à Xf, investigações sobre a sua biologia são importantes para o desenvolvimento de estratégias para o controle da CVC. Assim sendo, esse projeto de pesquisa tem como objetivo a identificação de genes de Xf com expressão alterada em resposta ao efeito de concentrações subinibitórias de gomesina, um peptídeo antimicrobiano isolado dos hemócitos da aranha Acanthoscurria gomesiana. É conhecido que doses subletais de substâncias antibióticas podem modular a expressão gênica de bactérias, constituindo uma ferramenta para a identificação, tanto de mecanismos de resistência desenvolvidos contra antibióticos, quanto de circuitos genéticos eventualmente afetados por estas substâncias. A cepa de Xf a ser utilizada será a 9a5c, que inequivocamente é capaz de causar a CVC e teve seu genoma completamente seqüenciado. A metodologia está baseada na utilização de microarrays de DNA em lâminas de vidro planejados e construídos por nosso grupo que está associado ao CAGE (Cooperação para Análise de Genes e sua Expressão) no Departamento de Bioquímica do IQUSP, representando 2692 CDS dessa cepa (94.5% de todas as CDS anotadas no genoma). Alguns genes diferencialmente expressos nas condições investigadas serão selecionados para caracterização adicional tanto bioquimicamente como através de genética molecular. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SILVA, Patricia Isabela Pessoa da. Identificação de genes com expressão modulada por estreptomicina e de genes associados à virulência e patogenicidade em Xylella fastidiosa. 2010. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.