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Assinaturas de seleção em três linhas de bovinos Nelore selecionados para características de crescimento

Texto completo
Autor(es):
Diércles Francisco Cardoso
Número total de Autores: 1
Tipo de documento: Tese de Doutorado
Instituição: Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias.
Data de defesa:
Membros da banca:
Fábio Ricardo pablos de Souza; Lucia Galvão de Albuquerque; Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo; Marcos Eli Buzanskas
Orientador: Humberto Tonhati; Fernando Sebastián Baldi Rey; Maria Eugênia Zerlotti Mercadante; Henner Simianer
Resumo

Análises de assinaturas de seleção são ferramentas úteis para identificação de padrões genômicos estabelecidos devido às interações humanas com animais domésticos. Em algumas situações, a estratificação dentro de uma raça permite a comparações genômicas entre subpopulações para elucidar assinaturas de seleção. O presente estudo teve o objetivo de analisar a estratificação existente em uma população experimental de bovinos da raça Nelore com três linhas de seleção e revelar assinaturas de seleção pertinentes à seleção direcional para aumento no peso ao sobreano. Para estes fins, foram utilizados animais genotipados com o painel de alta densidade de SNPs (Illumina® BovineHD beadchip - 777K), sendo 674 animais pertencentes à duas linhas mantidas sob seleção direcional para aumento do peso ao sobreano e 89 animais pertencentes a uma linha mantida sob seleção estabilizadora, baseada na mesma característica. A estratificação populacional foi avaliada pela análise de escalonamento multidimensional da matriz de distâncias genômicas e também pela análise da ancestralidade individual estimada a partir da matriz de marcadores. As assinaturas de seleção foram avaliadas com três métodos complementares, o índice de fixação de Wright (FST), a homozigose do haplótipo estendido entre populações (XP-EHH) e o escore de integração dos haplótipos (iHS). As diferentes abordagens utilizadas na avaliação da estrutura de populações apresentaram elevada consistência, revelando separação da população e... (AU)

Processo FAPESP: 12/24600-4 - Identificação de assinaturas de seleção em três linhagens de bovinos Nelore selecionadas para crescimento
Beneficiário:Diercles Francisco Cardoso
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado