Assinaturas de seleção em três linhas de bovinos Nelore selecionados para características de crescimento

Autor(es)

Diércles Francisco Cardoso

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Instituição: Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias.
• Data de defesa: 28 jul. 2016

Membros da banca

Fábio Ricardo pablos de Souza; Lucia Galvão de Albuquerque; Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo; Marcos Eli Buzanskas

• Orientador: Humberto Tonhati; Fernando Sebastián Baldi Rey; Maria Eugênia Zerlotti Mercadante; Henner Simianer

Resumo

Análises de assinaturas de seleção são ferramentas úteis para identificação de padrões genômicos estabelecidos devido às interações humanas com animais domésticos. Em algumas situações, a estratificação dentro de uma raça permite a comparações genômicas entre subpopulações para elucidar assinaturas de seleção. O presente estudo teve o objetivo de analisar a estratificação existente em uma população experimental de bovinos da raça Nelore com três linhas de seleção e revelar assinaturas de seleção pertinentes à seleção direcional para aumento no peso ao sobreano. Para estes fins, foram utilizados animais genotipados com o painel de alta densidade de SNPs (Illumina® BovineHD beadchip - 777K), sendo 674 animais pertencentes à duas linhas mantidas sob seleção direcional para aumento do peso ao sobreano e 89 animais pertencentes a uma linha mantida sob seleção estabilizadora, baseada na mesma característica. A estratificação populacional foi avaliada pela análise de escalonamento multidimensional da matriz de distâncias genômicas e também pela análise da ancestralidade individual estimada a partir da matriz de marcadores. As assinaturas de seleção foram avaliadas com três métodos complementares, o índice de fixação de Wright (FST), a homozigose do haplótipo estendido entre populações (XP-EHH) e o escore de integração dos haplótipos (iHS). As diferentes abordagens utilizadas na avaliação da estrutura de populações apresentaram elevada consistência, revelando separação da população e... (AU)

• Processo FAPESP: 12/24600-4 - Identificação de assinaturas de seleção em três linhagens de bovinos Nelore selecionadas para crescimento
• Beneficiário: Diercles Francisco Cardoso
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado