Assinaturas de seleção em três linhas de bovinos Nelore selecionados para características de crescimento

Autor(es)

Diercles Francisco Cardoso

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Jaboticabal. 2016-08-31.
• Instituição: Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal
• Data de defesa: 2016-07-28
• Orientador: Humberto Tonhati

Resumo

Análises de assinaturas de seleção são ferramentas úteis para identificação de padrões genômicos estabelecidos devido às interações humanas com animais domésticos. Em algumas situações, a estratificação dentro de uma raça permite a comparações genômicas entre subpopulações para elucidar assinaturas de seleção. O presente estudo teve o objetivo de analisar a estratificação existente em uma população experimental de bovinos da raça Nelore com três linhas de seleção e revelar assinaturas de seleção pertinentes à seleção direcional para aumento no peso ao sobreano. Para estes fins, foram utilizados animais genotipados com o painel de alta densidade de SNPs (Illumina® BovineHD beadchip – 777K), sendo 674 animais pertencentes à duas linhas mantidas sob seleção direcional para aumento do peso ao sobreano e 89 animais pertencentes a uma linha mantida sob seleção estabilizadora, baseada na mesma característica. A estratificação populacional foi avaliada pela análise de escalonamento multidimensional da matriz de distâncias genômicas e também pela análise da ancestralidade individual estimada a partir da matriz de marcadores. As assinaturas de seleção foram avaliadas com três métodos complementares, o índice de fixação de Wright (FST), a homozigose do haplótipo estendido entre populações (XP-EHH) e o escore de integração dos haplótipos (iHS). As diferentes abordagens utilizadas na avaliação da estrutura de populações apresentaram elevada consistência, revelando separação da população em três subgrupos que caracterizam as três diferentes linhas de seleção. A linha sob seleção estabilizadora apresenta-se como um grupo isolado, enquanto as linhagens mantidas sob seleção direcional apresentam certo nível de sobreposição. Os três métodos utilizados na identificação de assinaturas de seleção não apresentaram resultados coincidentes entre si, dado que não foram observadas intersecções entre as regiões consideradas assinaturas de seleção por cada um deles. No entanto, cada método revelou assinaturas de seleção em regiões genômicas abrangendo QTL bovinos de características de crescimento, previamente relatados na literatura, assim como genes envolvidos em funções biológicas relacionada ao metabolismo do crescimento. (AU)

• Processo FAPESP: 12/24600-4 - Identificação de assinaturas de seleção em três linhagens de bovinos Nelore selecionadas para crescimento
• Beneficiário: Diercles Francisco Cardoso
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado