Texto completo
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| Autor(es): |
Nicholas Di Paola
Número total de Autores: 1
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| Tipo de documento: | Tese de Doutorado |
| Imprenta: | São Paulo. |
| Instituição: | Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) |
| Data de defesa: | 2018-03-21 |
| Membros da banca: |
Paolo Marinho de Andrade Zanotto;
Daniel José Galafasse Lahr;
Carlos Frederico Martins Menck;
Saulo Duarte Passos;
Enrique Mario Boccardo Pierulivo
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| Orientador: | Paolo Marinho de Andrade Zanotto |
| Resumo | |
A fragmentação e a invasão de florestas tropicais e a crescente concentração de assentamentos humanos aumentaram exponencialmente as chances de exposição a vírus emergentes e emergentes. Dado o grande potencial de espalhamento de patógenos em população humanas, a identificação e caracterização de agentes patogênicos circulantes podem melhorar a atenção primária e as capacidades de diagnóstico para um agente emergente futuro. As abordagens moleculares e metagenômicas que utilizam as tecnologias de sequenciação da próxima geração levaram a descoberta e caracterização de muitos vírus emergentes na última década. Além disso, as abordagens in silico também podem ajudar a identificar vírus emergentes usando apenas dados de sequenciamento publicamente disponíveis. Além disso, estimar a ascendência filogenética e até mesmo analisar as mudanças no uso de codons são ferramentas adicionais que podem melhorar a nossa compreensão de vírus emergentes ou reemergentes. Este projeto visou aplicar essas ferramentas em ambos os vírus que poderiam estar circulando no Brasil: Parvovírus B19 e vírus da Febre Amarela. Também exploramos as aplicações de modelos ocultos de Markov e índice de adaptação de codons usando dados publicamente disponíveis. Esperamos que este trabalho forneça uma prova de conceito para futuros projetos metagenômicos e demonstre a utilidade das várias técnicas moleculares e bioinformáticas no estudo de vírus emergentes. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 13/22136-1 - Aplicação de metagenômica para descoberta de novos vírus na Mata Atlântica paulista |
| Beneficiário: | Nicholas Di Paola |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |