Sequenciamento de alto desempenho para quantificação da doença residual mínima em leucemia linfoide aguda

Autor(es)

Guilherme Navarro Nilo Giusti

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
• Data de defesa: 2019-02-22

Membros da banca

José Andrés Yunes; Márcio José da Silva; Juliana Godoy Assumpção

• Orientador: José Andrés Yunes

Resumo

A leucemia linfoide aguda (LLA) é o câncer mais comum na criança. Os atuais protocolos de tratamento da LLA pediátrica alcançam índices de sobrevida livre de doença que se aproximam de 90%. Parte desse sucesso se deve à alocação dos pacientes em diferentes grupos de risco, segundo fatores prognósticos obtidos ao longo do tratamento. A resposta inicial ao tratamento, avaliada pela quantificação das células leucêmicas residuais do paciente, ou doença residual mínima (DRM), é um dos mais importantes fatores para a identificação desses grupos de risco. O protocolo do Grupo Brasileiro de Tratamento da Leucemia Infantil (GBTLI LLA-2009), usa a DRM dos dias 15 e 35 do tratamento, avaliada por citometria de fluxo e por PCR quantitativo (qPCR) respectivamente, para alocação dos pacientes nos grupos para diferentes esquemas de tratamento quimioterápico. A avaliação da DRM por citometria de fluxo (DRM-CF) e qPCR (qPCR DRM) é cara, exige muita experiência e demanda análise imediata (citometria) ou demorada das amostras (qPCR), dificultando seu uso em abrangência nacional. O número de crianças que têm se beneficiado do exame de DRM é de apenas 100 por ano (3,2%). Nesse projeto padronizou-se o uso do sequenciamento de última geração (NGS) para a quantificação da DRM em crianças com LLA-B derivada, método que apresenta vantagens em termos de rapidez e escalabilidade. Uma vez padronizado, o método de análise de DRM por sequenciamento (NGS DRM) foi validado em amostras de LLA-B derivada pediátrica retrospectivamente analisadas no Centro Infantil Boldrini. Resultados NGS DRM foram comparados a resultados de qPCR DRM para as mesmas amostras, obtendo uma taxa de satisfatoriedade de 88,5% e um coeficiente de correlação de Pearson de 0,86. Como próximos passos, esperamos continuar o aperfeiçoamento do método, elevando a sua sensibilidade e acurácia, adicionando outros marcadores associados à LLA-B derivada pediátrica ao protocolo e adaptando-o para outras variedades de leucemias (AU)

• Processo FAPESP: 17/03942-8 - Sequenciamento de alto desempenho para quantificação da doença residual mínima em leucemia linfóide aguda
• Beneficiário: Guilherme Navarro Nilo Giusti
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado