Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar.

Autor(es)

Guilherme Marcello Queiroga Cruz

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI)
• Data de defesa: 2014-05-09

Membros da banca

Marie Anne van Sluys; Marcos Silveira Buckeridge; Cláudia Márcia Aparecida Carareto; Robson Francisco de Souza; Michel Georges Albert Vincentz

• Orientador: Marie Anne van Sluys

Resumo

Esta tese é estruturada em dois capítulos. O primeiro capítulo explora os retrotransposons com LTR (LTR-RT) em cana-de-açúcar e grande parte de seus resultados foram publicados no artigo \'\'Analysis of plant LTR-retrotransposons at the fine-scale family level reveals individual molecular patterns\'\'. Nossos resultados mostraram que as diferentes famílias de LTR-RT em cana-de-açúcar possuem estruturas e regulação distintas. O segundo capítulo desta tese visa responder a perguntas que surgiram durante a primeira metade deste trabalho, mas ao invés de focar no genoma de uma planta optamos por trabalhar com linhagem Del de LTR-RT em dez genomas de angiospermas sequenciados. Os resultados desta parte do trabalho foram submetidos para publicação no artigo intitulado \'\'Virus-like attachment sites and plastic CpG islands: landmarks of diversity in plant Del retrotransposons\'\'. Os resultados mostraram que a LTR é uma região dinâmica e importante para a evolução dos LTR-RTs. Nós especulamos que mudanças nas LTR atuem como gatilhos para a diversificação dos LTR-RTs. (AU)

• Processo FAPESP: 08/58243-8 - Retrotransposons das famílias scMaximus, scAle e scDel: desvendando as interações com o genoma da cana-de-açúcar
• Beneficiário: Guilherme Marcello Queiroga Cruz
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto