Sequenciamento de um código de barras como ferramenta para quantificação de alterações na dinâmica de populações celulares transduzidas com vetores lentivirais.

Autor(es)

Daniela Bertolini Zanatta

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI)
• Data de defesa: 2012-06-28

Membros da banca

Bryan Eric Strauss; Pedro Alexandre Favoretto Galante; Luiz Mario Ramos Janini; Elizabeth Angelica Leme Martins; Enrique Mario Boccardo Pierulivo

• Orientador: Bryan Eric Strauss

Resumo

Os vetores retrovirais representam uma das melhores opções para transferência e terapia gênica, pois fornecem expressão do transgene em longo prazo. Entretanto, a inserção do provírus pode causar mutagênese insercional, induzindo proto-oncogenes. Eventos deste tipo têm sido descritos em protocolos clínicos para o tratamento de SCID-X1, doença granulomatosa crônica e talessemia beta, quando vetores retrovirais (oncorretrovirus) foram utilizados. Atualmente, existem poucos métodos simples e rápidos para revelar e quantificar a expansão clonal. Assim, descrevemos a construção uma biblioteca de vetores contendo uma marcação aleatória, denominada código de barras. O sequenciamento do código de barras permitirá revelar, caracterizar e até quantificar a expansão clonal de uma população de células transduzidas. Esta metodologia ajudará a testar novos arranjos de promotores e genes terapêuticos, para o desenvolvimento de vetores mais seguros contribuindo para a redução da probabilidade de um evento de proliferação clonal desencadeado pela mutagênese insercional. (AU)

• Processo FAPESP: 07/56495-7 - Desenvolvimento de uma metodologia que permitira monitorar a clonalidade de celulas transduzidas com vetores lentivirais.
• Beneficiário: Daniela Bertolini Zanatta
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado