Verificação de proteínas da saliva candidatas a marcadores em CEC e sua correlação com o prognóstico

Autor(es)

Tatiane De Rossi

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
• Data de defesa: 2019-08-28

Membros da banca

Adriana Franco Paes Leme; Fabio Albuquerque Marchi; Nilva de Karla Cervigne; André Zelanis Palitot Pereira; Marcio Chaim Bajgelman

• Orientador: Adriana Franco Paes Leme

Resumo

O câncer bucal de maior prevalência em todo o mundo é o carcinoma espinocelular (CEC), totalizando mais de 90% de todos os casos de câncer na cavidade oral. É o sexto tipo de câncer mais comum na população mundial, com 355 mil novos casos por ano em todo o mundo. O fator prognóstico mais utilizado é o estadiamento clínico da doença, baseando-se na classificação de tumores TNM, sendo que a presença de metástase linfonodal é associada ao pior prognóstico. Entretanto, esse sistema de classificação não é perfeito, principalmente porque tumores com morfologia e estágios similares apresentam diferentes comportamentos devido às características biológicas distintas. Com isso, existe a necessidade de descoberta de marcadores específicos para predizer o prognóstico, permitindo o aumento na sobrevida global desses pacientes. A descoberta de que na saliva encontram-se perfis moleculares indicadores de doenças sistêmicas favoreceu o desenvolvimento de uma nova perspectiva de diagnóstico não invasivo: o diagnóstico salivar baseando-se na proteômica. Desta maneira, a hipótese desse estudo foi que a quantificação relativa da abundância de proteínas alvos na saliva de pacientes com CEC oral pode ser correlacionada com o prognóstico. Para testar essa hipótese, 40 amostras de saliva de pacientes com CEC oral com ou sem metástase linfonodal foram randomizadas e analisadas em blocos, em triplicatas, por meio do método para monitoramento seletivo de reações (SRM, selected reaction monitoring). 64 proteínas de interesse foram selecionadas e os peptídeos proteotípicos sintetizados para serem utilizados como referências. Os arquivos brutos foram analisados no programa Skyline. Os resultados mostram que 33 proteínas são diferencialmente abundantes no grupo de pacientes com metástase linfonodal em comparação ao grupo sem metástase pelo teste de Wilcoxon Mann-Whitney com valor de p<0,05 corrigido pelo FDR. Cinco peptídeos de cinco proteínas foram selecionados por diferentes algoritmos de aprendizado de máquina para quantificação `absoluta¿ utilizando a proteômica baseada em alvos. Os dados obtidos neste trabalho possuem valor prognóstico e complementam o prognóstico e decisão clínica, permitindo a avaliação do perfil de risco do paciente com CEC oral e a orientação de estratégias terapêuticas de intervenção (AU)

• Processo FAPESP: 15/12431-1 - Verificação de proteínas da saliva candidatas a marcadores em CEC e sua correlação com o prognóstico
• Beneficiário: Tatiane de Rossi Mazo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado