Ferramentas genômicas e moleculares para caracterização genética e predição genômica em seringueira

Autor(es)

Felipe Roberto Francisco

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
• Data de defesa: 2023-02-14

Membros da banca

Anete Pereira de Souza; Marcelo Falsarella Carazzolle; Renato Vicentini; Américo José Carvalho Viana; Marcelo Mollinari

• Orientador: Livia Moura de Souza; Anete Pereira de Souza

Resumo

A Hevea brasiliensis, mais conhecida como seringueira, é uma espécie emblemática com centro de origem na bacia amazônica. É considerada a espécie mais importante do gênero Hevea por ser a única espécie capaz de produzir borracha natural em quantidade e qualidade para suprir a demanda mundial dessa matéria prima, componente essencial para mais de 40.000 produtos. Apesar de conter o centro de origem da seringueira e grandes áreas com clima adequado para o cultivo da espécie, o Brasil é hoje um importador dessa matéria prima, pois nas áreas com condições climáticas ótimas para o cultivo da espécie a heveicultura é impossibilitada por conta da presença do fungo Pseudocercospora ulei causador da doença mal-das-folhas (SALB). Uma alternativa para o cultivo no país foi o plantio em regiões conhecidas como área de escape onde o clima seco e frio impossibilita a proliferação da SALB, da mesma forma que é um clima inadequado para o cultivo dos genótipos mais produtivos. Neste contexto existe uma grande necessidade do melhoramento genético principalmente visando o cultivo nessas regiões. A biologia molecular pode contribuir com o melhoramento genético da espécie possibilitando fazer uso da seleção assistida por marcadores (MAS) utilizando ferramentas como seleção genômica (GS) e associação genômica ampla (GWAS). Esta tese apresenta pela primeira vez o uso de seleção genômica em seringueira fazendo uso de marcadores do tipo single nucleotide polymorphism (SNPs) incluindo a interação genótipo x ambiente no modelo preditivo. Utilizando tais modelos foi possível obter um ganho genético esperado cinco vezes superior ao que se espera no melhoramento genético convencional. Além disso, também abordamos pela primeira vez a integração de associação genômica ampla com redes biológicas complexas para identificação e caracterização dos principais mecanismos moleculares envolvidos no crescimento da espécie. Mostrando principalmente a importância de genes envolvidos com resistência a estresse abiótico nesse processo, como SBT 4.6, GK 1, IQM 2 e elementos de transposons (AU)

• Processo FAPESP: 18/18985-7 - Mapa genético integrado e seleção genômica ampla visando caracteres de importância econômica em seringueira
• Beneficiário: Felipe Roberto Francisco
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto