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André Fujita

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

possui graduação em Ciência da Computação (2003), doutorado em Bioinformática (2007) e livre-docência (2016), todos pela Universidade de São Paulo. Realizou pós-doutorado no Instituto de Ciências Médicas da Universidade de Tóquio (2007-2009) e no Computational Science Research Program do RIKEN (2009-2011) (Japão). Foi Pesquisador Visitante do Cancer Research Institute da Universidade de Kanazawa (Japão) em 2014 e 2015. Atualmente é pesquisador convidado na Universidade de Leipzig (Alemanha). Recebeu prêmios de melhor tese em ciência da computação pela Sociedade Brasileira de Computação (SBC), Menção Honrosa no prêmio CAPES de teses na área de Ciências Biológicas I, Jovem Pesquisador Destaque pela Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C) e Fellowships do Alexander von Humboldt Foundation (Alemanha), Academy of Medical Sciences - Newton Advanced Fund (the Royal Society, Reino Unido), Special Postdoctoral Researcher Program (RIKEN - Japão). Trabalha com temas relacionados à conectividade e métodos estatísticos em grafos, ambos com aplicações na análise de dados biológicos em larga escala ("omics", EEG, fMRI). Atualmente é Professor Associado do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo (USP) e vice-coordenador do programa de pós-graduação interunidades em bioinformática. A página pessoal encontra-se em: http://www.ime.usp.br/~fujita (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Em andamento (mais recentes)

  • Resumo

    Recentemente tem sido demonstrado que as estruturas da rede funcional do cérebro e das redes regulatórias de genes são mais adequadas para caracterizar os estados do organismo biológico do que a análise individual de suas partes. Além disso, é sabido que tais redes não são exatamente iguais mesmo entre indivíduos do mesmo grupo devido a variabilidade intrínseca. Assim, métodos tradicio...

    Métodos estatísticos para grafos com aplicações em ciências da vida, AP.R
Concluídos (mais recentes)
Bolsas no país
Em andamento (mais recentes)

  • Resumo

    O corpo caloso é a maior estrutura de matéria branca do cérebro humano. Uma das suas funções é facilitar a interação entre os hemisférios esquerdo e direito. Anormalidades na morfologia do corpo caloso já foram reportadas em diversos transtornos neuropsiquiátricos, como esquizofrenia, transtorno do espectro autista, transtorno de déficit de atenção e hiperatividade, síndrome da mão al...

    Identificação de variáveis associadas à estrutura de grafos e aplicações em neurociência, BP.DR
Concluídas (mais recentes)
Bolsas no exterior
Concluídas (mais recentes)

  • Resumo

    A teoria dos grafos é utlizada em muitas áreas do conhecimento. Por exemplo, em biologia molecular grafos podem representar redes de interação proteína-proteína ou redes de regulação genética; e em neurociência eles são utilizados para estudar redes funcionais do cérebro. Como redes do mundo real usualmente apresentam flutuações intrínsecas (por exemplo, redes funcionais do cérebro pod...

    Comportamento assintótico de estimadores de parâmetros e estatísticas de teste para grafos, BE.EP.DR
Apoio FAPESP em números*
*Quantidades atualizadas em 20/10/2018
1Auxílios à pesquisa em andamento
2Auxílios à pesquisa concluídos
1Bolsas no país em andamento
3Bolsas no país concluídas
1Bolsas no exterior concluídas
8Todos os Auxílios e Bolsas
Colaboradores mais frequentes em auxílios e bolsas FAPESP
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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador
Análise espectral Análise estatística de dados Bioinformática Biologia computacional Biologia molecular Causalidade de Granger Ciência da Computação Ciências Exatas e da Terra Comportamento e mecanismos comportamentais Conectividade cerebral Corpo caloso Densidade espectral Estatística computacional Estatística Expressão gênica Grafos aleatórios Interdisciplinar Matemática da Computação Metodologia e Técnicas da Computação Modelagem de dados Neoplasias cerebrais Neurociências Redes complexas Regulação gênica Ressonância magnética Teoria dos grafos
Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (13)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações13
Citações78
Cit./Artigo6,0
Dados do Web of Science

SATO, JOAO RICARDO; VIDAL, MACIEL CALEBE; SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; MASSIRER, KATLIN BRAUER; FUJITA, ANDRE. Complex Network Measures in Autism Spectrum Disorders. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 15, n. 2, p. 581-587, . Citações Web of Science: 1. (13/03447-6, 13/10498-6, 14/09576-5, 13/00506-1, 12/00195-3)

FONSECA, MONIQUE T.; RODRIGUES, ABNER C.; CEZAR, LUANA C.; FUJITA, ANDRE; SORIANO, FRANCISCO G.; STEINER, ALEXANDRE A.. Spontaneous hypothermia in human sepsis is a transient, self-limiting, and nonterminal response. Journal of Applied Physiology, v. 120, n. 12, p. 1394-1401, . Citações Web of Science: 6. (09/15530-0, 12/03831-8, 11/50761-2, 13/00506-1, 14/09576-5)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL Y.; PATRIOTA, ALEXANDRE G.; SATO, JOAO R.. A non-parametric statistical test to compare clusters with applications in functional magnetic resonance imaging data. STATISTICS IN MEDICINE, v. 33, n. 28, p. 4949-4962, . Citações Web of Science: 2. (13/10498-6, 14/09576-5, 11/50761-2, 12/21788-2)

KINKER, GABRIELA SARTI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM; LIMA, FELIPE PRATA; FUJITA, ANDRE. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 3. (15/01507-7, 14/27287-0, 13/03447-6, 14/09576-5, 15/01587-0)

TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; SATO, JOAO RICARDO; FERREIRA, CARLOS EDUARDO; FUJITA, ANDRE. Discriminating Different Classes of Biological Networks by Analyzing the Graphs Spectra Distribution. PLoS One, v. 7, n. 12, . Citações Web of Science: 14. (11/07762-8, 10/01394-4)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL Y.; PATRIOTA, ALEXANDRE G.. A non-parametric method to estimate the number of clusters. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 73, p. 27-39, . Citações Web of Science: 19. (11/07762-8)

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; DE ALMEIDA GALATRO, THAIS FERNANDA; WATANABE, RODRIGO AKIRA; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO; NAGAHASHI MARIE, SUELY KAZUE; FUJITA, ANDRE. CoGA: An R Package to Identify Differentially Co-Expressed Gene Sets by Analyzing the Graph Spectra. PLoS One, v. 10, n. 8, . Citações Web of Science: 3. (13/03447-6, 12/25417-9, 11/50761-2, 14/09576-5)

SATO, JOAO RICARDO; BALARDIN, JOANA; VIDAL, MACIEL CALEBE; FUJITA, ANDRE. Identification of segregated regions in the functional brain connectome of autistic patients by a combination of fuzzy spectral clustering and entropy analysis. JOURNAL OF PSYCHIATRY & NEUROSCIENCE, v. 41, n. 2, p. 124-132, . Citações Web of Science: 2. (11/50761-2, 14/09576-5)

VIDAL, MACIEL C.; SATO, JOAO R.; BALARDIN, JOANA B.; TAKAHASHI, DANIEL Y.; FUJITA, ANDRE. ANOCVA in R: A Software to Compare Clusters between Groups and Its Application to the Study of Autism Spectrum Disorder. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, . Citações Web of Science: 0. (14/09576-5, 13/03447-6, 13/10498-6, 15/01587-0, 16/13422-9)

AZEVEDO, HATYLAS; FUJITA, ANDRE; BANDO, SILVIA YUMI; IAMASHITA, PRISCILA; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO. Transcriptional Network Analysis Reveals that AT1 and AT2 Angiotensin II Receptors Are Both Involved in the Regulation of Genes Essential for Glioma Progression. PLoS One, v. 9, n. 11, . Citações Web of Science: 9. (11/07762-8, 05/56446-0, 11/50761-2, 09/53443-1)

SANTOS, SUZANA DE SIQUEIRA; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; NAKATA, ASUKA; FUJITA, ANDRE. A comparative study of statistical methods used to identify dependencies between gene expression signals. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, v. 15, n. 6, p. 906-918, . Citações Web of Science: 19. (11/07762-8, 13/03447-6, 11/50761-2, 12/25417-9)

FUJITA, ANDRE; TAKAHASHI, DANIEL YASUMASA; BALARDIN, JOANA BISOL; VIDAL, MACIEL CALEBE; SATO, JOAO RICARDO. Correlation between graphs with an application to brain network analysis. COMPUTATIONAL STATISTICS & DATA ANALYSIS, v. 109, p. 76-92, . Citações Web of Science: 0. (13/10498-6, 16/13422-9, 13/00506-1, 15/01587-0)

GUZMAN, GROVER E. C.; SATO, JOAO R.; VIDAL, MACIEL C.; FUJITA, ANDRE. Identification of alterations associated with age in the clustering structure of functional bra in networks. PLoS One, v. 13, n. 5, . Citações Web of Science: 0. (16/13422-9, 15/01587-0)

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