CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ) (Instituição-sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Israel
Possui graduação em Bioquímica e Química pela University of Toronto (1985), mestrado em Bioquímica também pela University of Toronto (1988) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1994). Atualmente é professor Titular no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. O foco principal da sua pesquisa é entender a base estrutural de processos importantes para a comportamentos bacterianos complexos, utilizando como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico. Os sistemas sob estudo incluem: i) Vias de sinalização que envolvem o importante segundo mensageiro bis(3´-5´)diGMP cíclico (c-diGMP) que controla comportamentos complexos em bactéria como produção de fatores patogênicos, pili de tipo IV, motilidade e formação de biofilmes, ii) O funcionamento e regulação do pilus do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para se translocar sobre superfícies sólidas (motilidade twitching ) e para se organizar em biofilmes, iii) O funcionamento do sistema de secreção do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para transferir toxinas para outras bactérias, iv) O fenômeno de 'quorum sensing' pelo qual bactérias dentro de uma população coordenam suas atividades em uma maneira dependente de densidade celular. Suas pesquisas técnicas de biologia estrutural (cristalografia, microscopia eletrônica e RMN de proteínas), espectroscopia, microscopia de fluorescência, produção de nocautes gênicos e a análise de redes de interação proteína-proteína. (Fonte: Currículo Lattes)
Uma vez instalados, esses acessórios nos permitirão analisar amostras CryoEM em casa no Institute of Chemistry, USP. Este conjunto de acessórios será instalado no microscópio eletrônico de transmissão JEOL modelo JEM-2100 (com peça de pole de alta resolução EM-20720) que atualmente está localizado na Central Analítica do Instituto de Química da USP. A) O "cryoholder" permitirá a transferê…
O Vitrobot (Vitrification Robot) é um dispositivo totalmente controlado por PC para vitrificação (arrefecimento rápido) de amostras aquosas depositadas em uma grade crio-EM. O instrumento é projetado para produzir consistentemente espécimes excelentes para microscopia crio-eletrônica. O processo de imersão, mancha e vitrificação é totalmente automatizado após a colocação de um frasco na c…
EMU concedido no processo 2017/17303-7: Sistema AKTA de Cromatografia Líquida. Sistema de cromatografia líquida necessária para purificação de proteínas, protocolo central do presente projeto. (AU)
Xanthomonas citri subsp citri (Xac) é o agente patogénico causador do cancro cítrico, uma das doenças que mais causa perdas económicas no mundo todo. Xac se espalha das plantas afetadas para plantas saudáveis principalmente através da chuva e do vento e tem a capacidade de sobreviver por longos períodos em diferentes superfícies geralmente devido à formação de biofilmes. O biofilme bacter…
Desde a institucionalização dos recursos da reserva técnica, em seus Processos07/50983-0, 08/58147-9, 09/54438-1, 10/52386-1, 11/51756-2, 12/51565-5, 13/23781-8, e 2014/25980-0 em comum acordo entre os chefes dos dois Departamentos e a Direção do IQ-USP, e com a aprovação da Congregação, esses recursos estão sendo distribuídos segundo as rubricas (1) material permanente no país; (2) servi…
Neste projeto temático pretendemos desenvolver duas vertentes de pesquisa sobre a biologia do fitopatógeno Xanthomonas citri (Xac), o agente causador do cancro cítrico. i) Metabolismo do segundo mensageiro c-di-GMP: síntese, degradação e receptores. Bactérias podem adotar múltiplos estilos de vida. Em um extremo, há crescimento planctônico em meio líquido em que células vivem individualme…
Os pili de T2SS, T3SS, T4SS e T4P medeiam a ligação de bactérias a outras estruturas que podem ser outras células, fagos ou superfícies inanimadas. Este apego muitas vezes pode levar à transferência de fatores de virulência, invasão por um fago ou a formação de biofilmes. Os pili do tipo IV (T4P) são sistemas de secreção de tipo II de versões especializadas (T2SSs) que translocam proteína…
R-bodies são corpos proteicos, insolúveis, em forma de fita enrolada cilindricamente que se estira (e se enrola de novo, reversivelmente) quando sob determinadas condições, tais como baixo pH, força iônica e presença ou ausência de certos íons. Esta estrutura proteica foi inicialmente encontrada somente em bactérias endossimbióticas obrigatórias, sendo que sua descoberta se deu em cepas "…
O VirD4 é uma ATPase que seleciona proteínas a serem secretadas pela maioria dos T4SSs. Nós mostramos que VirD4 de Xanthomonas citri reconhece domínios conservados chamados XVIPCD encontrados no C-terminal de toxinas (X-Tfes) secretadas (Alegria et al., 2005). Estamos interessados em entender a estrutura do complexo VirD4-XVIPCD, como o complexo é transferido para o resto da maquinaria do…
Bactérias utilizam diferentes sistemas de secreção para o transporte de proteínas para outras bactérias, para células eucarióticas ou para serem liberadas no meio extracelular. Dentre eles, o sistema de secreção do tipo IV, T4SS, é talvez o mais versátil, estando presente tanto em bactérias Gram positivas e Gram negativas, e também sendo capaz de transportar complexos proteína-DNA mediand…
Os sistemas de secreção bacterianos são estruturas versáteis que podem secretar proteínas e DNA para o meio extracelular ou para dentro de células-alvo. Os sistemas de secreção do tipo IV (T4SS) são complexos formados por 12 proteínas (VirB1-VirB11 e VirD4) e desempenham papel fundamental na virulência de diferentes espécies bacterianas. Nos últimos dez anos, nosso grupo tem estudado int…
Durante a morte de bactérias vizinhas induzida pelo Sistema de Secreção do Tipo IV (T4SS) por Xanthomonas citri (Xac), diversas proteínas efetoras são secretadas e injetadas nas células alvo por um mecanismo contato-dependente. O primeiro objetivo deste projeto será investigar a função dessas proteínas efetoras. A avaliação da atividade de deleção de diferentes mutantes efetores em bactér…
Bactérias usam diferentes sistemas de secreção para o transporte de proteínas para outras bactérias, células eucarióticas ou para secreção para o meio extracelular. Entre eles, o sistema de secreção do tipo IV, T4SS, talvez seja o mais versátil, estando presente tanto em bactérias Gram-positivas quanto Gram-negativas, sendo capaz de transportar complexos proteína-DNA, de forma a mediar a …
Um dos principais objetivos deste projeto de pós-doutorado é a obtenção de informação estrutural sobre o complexo central (core complex) do Sistema de Secreção de Tipo IV de Xanthomonas citri, o qual forma o poro através de ambas camadas de membrana (interna e externa) do envelope bacteriano. Este complexo é composto de 14 cópias de cada uma das subunidades VirB7, VirB9 e VirB10. Devido a…
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
| Publicações | 22 |
| Citações | 194 |
| Cit./Artigo | 8,8 |
| Dados do Web of Science | |
ANTUNES, VICTOR U.; LLONTOP, EDGAR E.; VASCONCELOS, FERNANDA N. DA COSTA; DE LOS SANTOS, YOSSEF LOPEZ; OLIVEIRA, RONALDO J.; LINCOPAN, NILTON; FARAH, CHUCK S.; DOUCET, NICOLAS; MITTERMAIER, ANTHONY; FAVARO, DENIZE C.. Importance of the beta 5-beta 6 Loop for the Structure, Catalytic Efficiency, and Stability of Carbapenem-Hydrolyzing Class D beta-Lactamase Subfamily OXA-143. BIOCHEMISTRY, v. 58, n. 34, p. 3604-3616, AUG 27 2019. Citações Web of Science: 0. (17/17303-7, 17/22822-3)
SGRO, GERMAN G.; OKA, GABRIEL U.; SOUZA, DIORGE P.; CENENS, WILLIAM; BAYER-SANTOS, ETHEL; MATSUYAMA, BRUNO Y.; BUENO, NATALIA F.; DOS SANTOS, THIAGO RODRIGO; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; SALINAS, ROBERTO K.; et al. Bacteria-Killing Type IV Secretion Systems. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, MAY 21 2019. Citações Web of Science: 2. (18/01852-4, 17/02178-2, 17/17303-7)
OLIVEIRA, LUCIANA COUTINHO; SOUZA, DIORGE PAULO; OKA, GABRIEL UMAJI; LIMA, FILIPE DA SILVA; OLIVEIRA, RONALDO JUNIO; FAVARO, DENIZE CRISTINA; WIENK, HANS; BOELENS, ROLF; FARAH, CHUCK SHAKER; SALINAS, ROBERTO KOPKE. VirB7 and VirB9 Interactions Are Required for the Assembly and Antibacterial Activity of a Type IV Secretion System. Structure, v. 24, n. 10, p. 1707-1718, OCT 4 2016. Citações Web of Science: 3. (11/07777-5, 13/17883-2)
SOUZA, DIORGE P.; ANDRADE, MAXUEL O.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; ARANTES, GUILHERME M.; FARAH, CHUCK S.; SALINAS, ROBERTO K.. A Component of the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System Combines a VirB7 Motif with a N0 Domain Found in Outer Membrane Transport Proteins. PLOS PATHOGENS, v. 7, n. 5, p. e1002031, 2011. Citações Web of Science: 29. (05/59243-3, 07/52735-3, 06/61091-0)
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GUZZO, CRISTIANE R.; NAGEM, RONALDO A. P.; GALVÃO-BOTTON, LEONOR M. P.; GUIMARÃES, BEATRIZ G.; MEDRANO, FRANCISCO J.; BARBOSA, JOÃO A. R. G.; FARAH, SHAKER CHUCK. Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of YaeQ (XAC2396) from Xanthomonas axonopodis pv. citri. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 61, n. 5, p. 493-495, May 2005. (01/07534-3)
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BAYER-SANTOS, ETHEL; CENENS, WILLIAM; MATSUYAMA, BRUNO YASUI; OKA, GABRIEL UMAJI; DI SESSA, GIANCARLO; MININEL, IZABEL DEL VALLE; ALVES, TIAGO LUBIANA; FARAH, CHUCK SHAKER. The opportunistic pathogen Stenotrophomonas maltophilia utilizes a type IV secretion system for interbacterial killing. PLOS PATHOGENS, v. 15, n. 9, SEP 2019. Citações Web of Science: 1. (15/25381-2, 18/04553-8, 17/02178-2, 11/07777-5, 15/18237-2, 16/00458-5, 17/17303-7)
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DUNGER, GERMAN; GAROFALO, CECILIA G.; GOTTIG, NATALIA; GARAVAGLIA, BETIANA S.; PEREDA ROSA, MARIA C.; FARAH, CHUCK S.; ORELLANO, ELENA G.; OTTADO, JORGELINA. Analysis of three Xanthomonas axonopodis pv. citri effector proteins in pathogenicity and their interactions with host plant proteins. MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, v. 13, n. 8, p. 865-876, OCT 2012. Citações Web of Science: 13. (05/59243-3)
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BAYER-SANTOS, ETHEL; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; CESETI, LUCAS DE MORAES; RATAGAMI, CAMILA YURI; DE SANTANA, ELIANE SILVA; DA SILVA, ALINE MARIA; FARAH, CHUCK SHAKER; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA ELISA. Xanthomonas citri T6SS mediates resistance to Dictyostelium predation and is regulated by an ECF sigma factor and cognate Ser/Thr kinase. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 20, n. 4, SI, p. 1562-1575, APR 2018. Citações Web of Science: 6. (15/25381-2, 14/19720-6, 11/07777-5, 16/08400-6, 14/25261-4)
JUSTO AREVALO, SANTIAGO; ZAPATA SIFUENTES, DANIELA; HUALLPA, CESAR J.; LANDA BIANCHI, GIANFRANCO; CASTILLO CHAVEZ, ADRIANA; GARAVITO-SALINI CASAS, ROMINA; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO; PINEDA CHAVARRIA, ROBERTO. Global Geographic and Temporal Analysis of SARS-CoV-2 Haplotypes Normalized by COVID-19 Cases During the Pandemic. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, FEB 17 2021. Citações Web of Science: 0. (15/13318-4)
CESETI, LUCAS M.; DE SANTANA, ELIANE S.; RATAGAMI, CAMILA Y.; BARREIROS, YASMIN; LIMA, LIDIA DOS PASSOS; DUNGER, GERMAN; FARAH, CHUCK S.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.. The Xanthomonas citri pv. citri Type VI Secretion System is Induced During Epiphytic Colonization of Citrus. Current Microbiology, v. 76, n. 10, p. 1105-1111, OCT 2019. Citações Web of Science: 0. (11/22571-4, 16/08400-6, 14/19720-6, 17/02318-9, 18/01852-4, 14/25261-4, 11/07777-5)
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OLIVEIRA, MAYCON C.; TEIXEIRA, RAPHAEL D.; ANDRADE, MAXUEL O.; PINHEIRO, GLAUCIA M. S.; RAMOS, CARLOS H. I.; FARAH, CHUCK S.. Cooperative Substrate Binding by a Diguanylate Cyclase. Journal of Molecular Biology, v. 427, n. 2, p. 415-432, JAN 30 2015. Citações Web of Science: 10. (11/07777-5)
SIBINELLI-SOUSA, STEPHANIE; HESPANHOL, JULIA T.; NICASTRO, GIANLUCCA G.; MATSUYAMA, BRUNO Y.; MESNAGE, STEPHANE; PATEL, ANKUR; DE SOUZA, ROBSON F.; GUZZO, CRISTIANE R.; BAYER-SANTOS, ETHEL. A Family of T6SS Antibacterial Effectors Related to L,D-Transpeptidases Targets the Peptidoglycan. CELL REPORTS, v. 31, n. 12, JUN 23 2020. Citações Web of Science: 0. (18/04553-8, 17/02178-2, 16/09047-8, 19/00195-2, 17/17303-7, 18/25316-4, 16/00458-5, 18/13819-1)
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ALEGRIA, Marcos Castanheira. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos Loci hrp, vir e rpf de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 215 f. Tese (Doutorado) - Instituto de Química. Universidade de São Paulo (USP). São Paulo. (98/15371-2)
FERREIRA, Aurea Denise de Sousa Soller. Tropomiosinas contendo 5-hidroxitriptofano: sondas específicas para interações no filamento fino. 131 f. Tese (Doutorado) - Instituto de Química. Universidade de São Paulo (USP). São Paulo. (00/00686-0)