Ambiente de integração analítico envolvendo processos e bases de dados heterogêneos de genoma

Resumo

Um dos maiores problemas na área computacional de Genoma é a falta de padronização de processos e dados. Esta situação leva à criação de bases de dados física e logicamente heterogêneas, além de impossibilitar a avaliação da qualidade da informação. Existe hoje a necessidade clara de alternativas para integrar estas bases, representando um gargalo indesejado para a Bioquímica e um desafio para a Ciência da Computação. Este projeto propõe a elaboração de uma solução de integração de processos e bases de dados, utilizando transações aninhadas, para garantir a integridade da informação, e objeto integrador, responsável pela comunicação entre clientes, processos e gerenciadores de dados. Além disso, o trabalho propõe uma análise de desempenho do modelo relacional de dados para o tratamento de bancos de Genoma e a sugestão de arquiteturas não-convencionais que otimizam operações de busca e inserção em tais bases. (AU)