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Extração de DNA e amplificação de genes plastidiais de cactaceas do grupo de espécies Pilosocereus aurisetus

Processo: 08/50905-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2008
Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2009
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Evandro Marsola de Moraes
Beneficiário:Isabel Aparecida da Silva Bonatelli
Instituição Sede: Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Campus de Sorocaba. Sorocaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:05/55200-8 - Estudo filogeográfico do grupo de espécies relacionadas a Pilosocereus aurisetus (Cactaceae) utilizando DNA microssatélite nuclear e seqüências nucleotídicas do genoma do cloroplasto, AP.JP
Assunto(s):Filogeografia   Pilosocereus   Cloroplastos vegetais   Análise de sequência de DNA   Extração de DNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Cactaceae | Dna De Cloroplasto | Extracao De Dna | Filogeografia | Sequencias Genicas | Variacao Genetica

Resumo

Estudos filogeográficos são dependentes da obtenção de amostras de DNA de boa qualidade, bem como da amplificação de genes neutros que apresentem elevada variação. Para a realização de estudos filogeográficos em cactáceas, por exemplo, é necessário inicialmente superar as dificuldades verificadas na obtenção de amostras de DNA, pois a elevada quantidade de polissacarídeos e metabólitos secundários nos tecidos dessas plantas provoca a formação de complexos insolúveis com o ácido nucléico, prejudicando seu isolamento. Outra dificuldade a ser superada nos estudos com cactáceas é a baixa quantidade de variação encontrada nos genes do cloroplasto, os quais geralmente são utilizados em estudos filogeográficos de espécies vegetais. Assim, é necessário localizar e padronizar a amplificação de segmentos gênicos do cloroplasto com taxa de evolução elevada, adequada ao nível taxonômico abordado. O objetivo deste projeto é estabelecer um procedimento padronizado de extração de DNA de quatro espécies de cactáceas do grupo Pilosocereus aurisetus e realizar um estudo piloto para a escolha do segmento gênico no genoma do cloroplasto com base no nível de variação populacional verificado. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CALVENTE, ALICE; MORAES, EVANDRO M.; LAVOR, PAMELA; BONATELLI, ISABEL A. S.; NACAGUMA, PAMELA; VERSIEUX, LEONARDO M.; TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.. Phylogenetic analyses of Pilosocereus (Cactaceae) inferred from plastid and nuclear sequences. Botanical Journal of the Linnean Society, v. 183, n. 1, p. 25-38, . (05/55200-8, 08/50905-1, 10/02186-6)