Montagem e anotação do genoma de Methylobacterium mesophilicum SR1.6/6

Resumo

O gênero Methylobacterium é composto por bactérias de coloração rósea, metilotróficas (PPFMs) e que podem colonizar endofiticamente a planta hospedeira. Algumas espécies deste gênero são capazes de promover o crescimento, aumentar a atividade fotossintética da planta hospedeira e reduzir o ataque de patógenos. Este gênero tem despertado grande interesse científico pelo fato de possuir potencial para síntese de produtos biotecnológicos de alto valor agregado. Análises genômicas e proteômicas têm sido realizadas a fim de entender a interaçao existente entre Methylobacterium spp. e a planta hospedeira, pois pouco se conhece a respeito de mecanismos regulatórios que determinam a adaptaçao destas bactérias nos tecidos vegetais. A linhagem SR1.6/6 de M. mesophilicum é uma bactéria isolada de citros e devido a sua interação com a planta hospedeira e possivelmente com Xylella fastidiosa, tem sido foco de vários trabalhos. Dessa forma, o presente projeto tem como objetivo montar e anotar o genoma de M. mesophilicum, dentro do projeto "Identificação e caracterização de genes diferencialmente expressos na interação entre Methylobacterium mesophilicum e a planta hospedeira" (Proc. FAPESP 2010/07594-5). Os dados de seqüenciamento já foram obtidos via pirossequenciamento, gerando uma cobertura de 37X. Dessa forma, acreditamos que será possível fechar o genoma desta bactéria endofítica. Além disso, tendo em vista que outras espécies de Methylobacterium já foram seqüenciadas, será possível também comparar o genoma de espécies endofíticas (M. nodulans e M. mesophilicum) e não endofíticas (M. chloromethanicum, M. populi e M. radiotolerans). Por fim, este trabalho visa contribuir com subsídios para estudos de genes de interesse biotecnológico e principalmente associados interação microrganismos-planta. (AU)