Caracterização taxonômica de micobactérias do grupo Mycobacterium chelonae-M. abscessus sem identificação de espécie conclusiva

Resumo

O estudo a ser desenvolvido no pós-doutorado corresponde ao subprojeto 2 do projeto temático "Micobactérias e seus elementos extracromossômicos: caracterização molecular e aplicações biotecnológicas" (Processo 2011/18326-4). Atualmente, pertencem ao grupo Mycobacterium chelonae - Mycobacterium abscessus, as espécies M. chelonae, M. immunogenum, M. salmoniphilum e M. abscessus e duas subespécies (M. abscessus subsp. abscessus e M. abscessus subsp. bolletii). No subprojeto 2 serão estudados 35 isolados clínicos e ambientais pertencentes ao grupo M. chelonae-M. abscessus que ainda não foram definitivamente identificados e cuja classificação em um dos membros deste grupo não foi confirmada. As cepas tipo do grupo serão utilizadas para comparação. Os isolados do estudo serão caracterizados fenotipicamente e identificados pelos métodos PCR-Restriction Enzyme Analysis do gene hsp65 (PRA-hsp65), PRA-ITS (região espaçadora entre os genes 16S rDNA e 23S rDNA), sequenciamento de genes conservados e pelos kits comerciais INNO-LiPA MYCOBACTERIA V2 e GenoType Mycobacterium CS/AS. Será realizada, também, a análise do gene 16S rDNA por Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP) para determinação do número de operons rrn por genoma. Após estas análises, alguns isolados serão selecionados para avaliar a relação genômica pela técnica de Hibridização DNA-DNA. Pretende-se também realizar o sequenciamento de genomas e estudos de genômica comparativa, permitindo um maior conhecimento dos genes essenciais de cada espécie e da variabilidade desses genomas. (AU)