Desenvolvimento de ferramentas computacionais para a comparação dos níveis de expressão entre as linhagens de pragas da pecuária

Resumo

A proposta "Investigação das Bases Moleculares da Resistência de Rhipicephalus microplus e Cochliomyia hominivorax à Parasiticidas" combina o progresso do sequenciamento de segunda geração, abordando a análise de ambos, sequência nucleotídica e expressão gênica, para a caracterização da resposta metabólica a parasiticidas. Esta abordagem requer a comparação entre várias linhagens e doses do produto. Análise de sequências na escala proposta e sua comparação entre as diferentes amostras oferece uma série de desafios computacionais e estatísticos para lidar com o imenso volume de dados. Assim, a atuação de um técnico em informação nas atividades do projeto é de extrema importância para permitir a implementação das rotinas comuns de análise computacional através de um "pipeline" bem como o uso eficiente dos sistemas disponíveis para a análise exploratória dos dados. Como a metodologia empregada é relativamente recente, ainda existe uma grande demanda para otimização de algoritmos e programas, atividade que também exigirá o envolvimento do bolsista. (AU)