Busca de moldes estruturais para a engenharia de funções catalíticas

Resumo

A existência de uma relação entre a estrutura e a função de proteínas é bem conhecida. Sabe-se que as proteínas evoluíram para desenvolver uma estrutura estável e ótima para o exercício do seu papel funcional. No entanto, qual é a mínima informação necessária para a inserção de uma função proteica? Algumas abordagens já foram avaliadas neste contexto. Uma delas emprega o conceito de motivos espaciais esparsos para a definição de um papel funcional em enzimas, onde as coordenadas atômicas de alguns poucos aminoácidos são empregadas para a inferência de uma função. Neste projeto avaliaremos se a inserção de motivos espaciais esparsos de um sítio ativo razoavelmente simples é capaz de inserir elementos funcionais. Para esta finalidade, buscaremos inserir os motivos espaciais do sítio ativo de uma enzima polissacarídeo mono-oxigenase (previamente denominada hidrolase glicosídica 61 ou GH61) contendo duas histidinas e uma tirosina coordenando um átomo de cobre, em proteínas que contenham uma disposição ótima para esta inserção. A busca será realizada através de um critério geométrico usando o programa SMatch desenvolvido no grupo. A avaliação do ganho funcional será feita em duas etapas: a capacidade de interação com o cobre e a atividade mono-oxigenase. (AU)