| Processo: | 15/12784-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de outubro de 2015 |
| Data de Término da vigência: | 30 de novembro de 2015 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal |
| Pesquisador responsável: | Lincoln Suesdek Rocha |
| Beneficiário: | Camila Lorenz |
| Supervisor: | Peter G. Foster |
| Instituição Sede: | Instituto Butantan. São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Natural History Museum, London, Inglaterra |
| Vinculado à bolsa: | 13/05521-9 - Caracterização de padrões macroevolutivos em Culicidae (Diptera) mediante morfometria geométrica, sequenciamento genético e espectrometria de massa, BP.DR |
| Assunto(s): | Filogenia Genomas Genoma mitocondrial Culicidae Banco de dados |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Culicidae | Genome | Illumina | Neotropical | Filogenia |
Resumo Estudos recentes têm demonstrado que o genoma mitocondrial é um dos marcadores mais informativos para resolver relações filogenéticas em insetos. Além disso, os 37 genes existentes dentro dele são convenientes para reconstruções filogenéticas, já que não necessitam de um tempo computacional muito grande para rodar as análises e permitem conclusões estatisticamente confiáveis. Sendo assim, o objetivo deste estágio é analisar o genoma mitocondrial dos Culicidae para elaborar uma hipótese filogenética para o grupo, complementando as informações obtidas com os marcadores utilizados no projeto de doutorado regular. Serão analisados 96 genomas mitocondriais completos, incluindo 20 gêneros e 70 espécies diferentes, obtidos através da plataforma Illumina MiSeq. Será construído um banco de dados com os genes mitocondriais concatenados e separados para elaboração de árvores filogenéticas de máxima parcimônia, máxima verossimilhança e bayesiana. Os dados dos perfis proteicos evidenciados por MALDI-TOF e genes nucleares obtidos no projeto de doutorado regular também serão acrescentados nas análises filogenéticas, mediante construção de supermatrizes e superárvores. A exemplo de vários casos disponíveis na literatura, a utilização do genoma mitocondrial para reconstrução filogenética poderá ser bastante útil para entender a história evolutiva da família Culicidae. | |
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