Análise comparativa de genomas de quatro isolados de Xanthomonas albilineans e prospecção de genes alvo para estudo de associação a fenótipos conhecidos

Resumo

Xanthomonas albilineans é o agente responsável pela escaldadura das folhas em cana-de-açúcar. Esta cultura representa uma das culturas relevantes do agronegócio brasileiro por ser uma comódite importante no cenário mundial. Quatro isolados do campo foram sequenciados em parceria estabelecida em 2015 entre a Dra. Silvana Creste (IAC) e Dra. Marie-Anne Van Sluys. Análises preliminares desses isolados bacterianos revelaram a presença de segmentos genômicos únicos a cada isolado, bem como regiões altamente conservadas. Baseado nos dados reunidos e em análises de bioinformática - clusterização de genomas, análise de máxima entropia, análises de repertórios gênicos e outras - propomos a realização de um estudo comparativo entre os diferentes isolados. O estudo proposto visa à caracterização e a prospecção de sequências para posteriores estudos de associação entre genótipo e fenótipos conhecidos - níveis de severidade de doença variáveis dentro de uma escala de sintomas. Este projeto de pesquisa está vinculado ao projeto temático FAPESP "GEMAC - Genes genomes and transposable elements contribuition to plant-microbe interaction: a sugarcane study case", processo 2016/17545-8. (AU)