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Genoma de Gracilaria domingensis, uma macroalga de importância econômica e ambiental

Processo: 18/26220-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de abril de 2019
Data de Término da vigência: 31 de março de 2021
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Oceanografia - Oceanografia Biológica
Pesquisador responsável:Pio Colepicolo Neto
Beneficiário:Natalia Nakamura Gouvea
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/06931-4 - Biodiversidade e prospecção de algas de águas tropicais e da Antártica marítima, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Algas   Macroalgas   Gracilaria
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | Macroalga marinha

Resumo

Gracilaria domingensis é uma típica alga vermelha brasileira. Além de essencial para o ecossistema costeiro, tem grande importância econômica por ser fonte de extração de ficocolóides (ágar-ágar) e metabólitos secundários que apresentam uma larga aplicação industrial e biotecnológica. Muitas vias metabólicas têm sido elucidadas a partir de ferramentas de biologia molecular, abrindo o caminho para a geração de novos metabólitos bioativos em grande quantidade. Este projeto visa montar sequências (PacBio) para produzir scaffolds do genoma e anotar genes visando a descoberta de vias síntese de ágar e carboidratos em geral, transportadores de metais, metabolismo de halogênios, assimilação de nitrogênio, stress oxidativo e multicelularidade (processamento de RNA e fatores de transcrição), além de realizar uma análise comparativa com outros genomas. Para isso será selecionado um bioinformata para utilização e desenvolvimento de programas para montagem e anotação de genomas de eucariotos, como descritos no projeto. Espera-se criar bases para o estabelecimento de um novo organismo modelo brasileiro que permitirá o enriquecimento da ciência nacional nas áreas de biologia molecular e bioquímica de plantas, biorremediação, ecotoxicologia e bioprospeção de bioativos.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NAKAMURA-GOUVEA, NATALIA; ALVES-LIMA, CICERO; BENITES, LUIZ FELIPE; IHA, CINTIA; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; ALIAGA-TOBAR, VICTOR; CARNEIRO, MARCELLA; YOKOYA, NAIR S.; MARINHO-SORIANO, ELIANE; GRAMINHA, MARCIA A. S.; et al. Insights into agar and secondary metabolite pathways from the genome of the red alga Gracilaria domingensis (Rhodophyta, Gracilariales). JOURNAL OF PHYCOLOGY, v. 58, n. 3, p. 18-pg., . (18/26220-0, 16/06931-4, 19/06983-2)