Simulação computacional da interação entre o antibiótico linezolida e o sítio ativo da subunidade ribossômica 50S da bactéria Haloarcula marismortui.

Resumo

A linezolida foi o primeiro antibiótico da classe das Oxazolidinonas a ser sintetizado para fins farmacêuticos. Sendo inibidor da síntese proteica bacteriana, a molécula tornou-se muito favorável no combate a doenças causadas por bactérias multirresistentes a drogas gram-positivas. As propriedades biológicas e os estudos teóricos e experimentais têm esclarecido, nos últimos anos, a sua ação terapêutica. No presente projeto de pesquisa iremos estudar do ponto de vista da simulação computacional as interações e possíveis conformações adotadas pela linezolida na sua forma isolada e quando complexada no sítio de interação da subunidade ribossômica 50S. A partir das conformações obtidas no estado isolado e na presença de solventes (implícito e explícito) iremos comparar com aquela obtida pela técnica de difração de raios-x. Serão objeto de estudo, também, as propriedades espectroscópicas da linezolida como a absorção de luz circularmente polarizada e na região do ultravioleta. O projeto de pesquisa tem como objetivo principal fornecer subsídios para o entendimento das principais interações e conformações adotadas pela linezolida quando da formação do complexo com a unidade 50S e suas bases purínicas e pirimidínicas presentes no sítio de interação.