Estabelecimento de estratégias para estudar a complexidade espacial do proteoma tumoral

Resumo

A biologia celular estuda há alguns séculos a organização, estrutura e função das células nos diversos tecidos. Avanços importantes ocorreram nesta área, principalmente relacionados ao desenvolvimento tecnológico que permitem hoje, por exemplo, o diagnóstico e subclassificação de tumores utilizando-se marcadores moleculares que podem ser avaliados pelas mais diversas estratégias. Entretanto, a identificação do alvo molecular para o diagnóstico preciso é a informação fundamental ainda necessária para a expansão destas aplicações dentro de áreas como a biologia tecidual e patologia. Atualmente, grande importância vem sendo dada para as alterações da organização espacial das células nos tecidos sadios ou patológicos, bem como para a intercomunicação destas células. Na fronteira desse tipo de abordagem, estudos recentes combinam a análise da imagem de um tecido contendo diferentes fenótipos celulares com o perfil de biomoléculas identificadas em regiões com um conjunto homogêneo de células ou mesmo uma única célula. Cria-se assim, um perfil molecular-espacial bastante específico do tecido em questão, que permite o diagnóstico, direcionamento do tratamento ou mesmo prevenção da doença dentro do que é conhecido hoje como medicina de precisão. Com esta finalidade, iremos analisar através de abordagens proteômicas, tecidos tumorais obtidos em estudos clínicos em andamento na FMRP-USP, iniciando pelo estudo clínico CLARA para câncer renal, a fim de associar os perfis celulares e histológicos com os perfis proteômicos. As amostras serão segmentadas por microscopia de captura a laser e analisadas individualmente por proteômica de larga escala e também proteômica dirigida. Algumas proteínas relevantes identificadas nestes perfis serão selecionadas para a validação por imunoistoquímica e podem representar novos alvos para diagnóstico preciso ou subtipagem do tumor, contribuindo para os avanços da medicina de precisão e da oncologia moderna. (AU)