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Uma investigação abrangente da inter-relação entre retrocópias e câncer

Processo: 24/00078-4
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Beneficiário:Helena Beatriz da Conceição
Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/15579-8 - Retroelementos: uma força motriz criando novidades genéticas no genoma humano e de camundongos, AP.JP2
Assunto(s):Biologia computacional   Neoplasias   Duplicação gênica   Expressão gênica   Genômica   Retroelementos
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | câncer | Duplicação gênica | expressão gênica | Genômica | Retroelementos | Bioinformática

Resumo

É de conhecimento geral que tumores malignos apresentam um padrão de expressão gênica alterado, com diversos genes sobre ou sub expressos. Hoje, sabemos que diversas retrocópias são expressas e podem regular a expressão de seus genes codificadores ou dos genes vizinhos ao local em que estas estão inseridas. Hipotetizamos que retrocópias sem uma função conhecida podem ser funcionais emtumores. Neste projeto iremos identificar e analisar sistematicamente as retrocópias fixadas e polimórfica (restrito a humanos) com características funcionais alteradas em tumores. Nessa frente de trabalho iremos analisar aquelas retrocópias que são transcritas diferentemente, que formam quimeras gênicas, que sofrem mutações ou potencialmente abalam as regiões genômicas que estão inseridas. Tudo isso buscando por fenômenos específicos ou significativamentealterados em tumores.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CONCEICAO, HELENA B.; MERCURI, RAFAEL L., V; DE CASTRO, MATHEUS P. M.; OHARA, DANIEL T.; GUARDIA, GABRIELA D. A.; GALANTE, PEDRO A. F.. RCPedia: a global resource for studying and exploring retrocopies in diverse species. Bioinformatics, v. 40, n. 9, p. 5-pg., . (24/00078-4, 18/15579-8, 20/02413-4, 18/13613-4, 17/19541-2)