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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

USING GENOMIC DATA TO DEVELOP CHLOROPLAST DNA SSRS FOR THE NEOTROPICAL LIANA STIZOPHYLLUM RIPARIUM (BIGNONIEAE, BIGNONIACEAE)

Texto completo
Autor(es):
Beyer, Maila [1] ; Nazareno, Alison G. [1] ; Lohmann, Luia G. [1]
Número total de Autores: 3
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Inst Biociencias, Dept Bot, Rua Matao 277, BR-05508090 Sao Paulo, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 1
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: APPLICATIONS IN PLANT SCIENCES; v. 5, n. 10 OCT 2017.
Citações Web of Science: 0
Resumo

Premise of the study: We developed chloroplast microsatellite markers (cpSSRs) to be used to study the patterns of genetic structure and genetic diversity of populations of Stizophyllum riparium (Bignonieae, Bignoniaceae). Methods and Results: We used genomic data obtained through an Illumina HiSeq sequencing platform to develop a set of cpSSRs for S. riparium. A total of 36 primer pairs were developed, of which 28 displayed polymorphisms across 59 individuals from three populations. Two to 12 alleles were recorded, and the unbiased haploid diversity per locus ranged from 0.037 to 0.905. All 28 cpSSRs presented transferability to two closely related species, S. inaequilaterum and S. perforatum. Conclusions: We report a set of 28 cpSSRs for S. riparium. All markers were shown to be variable in S. riparium, indicating that these markers will be valuable for population genetic studies across S. riparium and congeneric species. (AU)

Processo FAPESP: 12/50260-6 - Estruturação e evolução da biota amazônica e seu ambiente: uma abordagem integrativa
Beneficiário:Lúcia Garcez Lohmann
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Processo FAPESP: 13/12633-8 - Filogeografia comparada de plantas na Amazônia Central
Beneficiário:Alison Gonçalves Nazareno
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado