Jansen-MIDAS: A multi-level photomicrograph segmentation software based on isotropic undecimated wavelets

Autor(es)

de Siqueira, Alexandre Fioravante ^[1] ; Cabrera, Flavio Camargo ^[2] ; Nakasuga, Wagner Massayuki ^[1] ; Pagamisse, Aylton ^[3] ; Job, Aldo Eloizo ^[2]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Estadual Campinas, IFGW, DRCC, BR-13083970 Sao Paulo - Brazil

^[2] UNESP Univ Estadual Paulista, DFQB, FCT, BR-19060900 Sao Paulo - Brazil

^[3] UNESP Univ Estadual Paulista, DMC, FCT, BR-19060900 Sao Paulo - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: MICROSCOPY RESEARCH AND TECHNIQUE; v. 81, n. 1, p. 22-32, JAN 2018.
• Citações Web of Science: 1

Resumo

Image segmentation, the process of separating the elements within a picture, is frequently used for obtaining information from photomicrographs. Segmentation methods should be used with reservations, since incorrect results can mislead when interpreting regions of interest (ROI). This decreases the success rate of extra procedures. Multi-Level Starlet Segmentation (MLSS) and Multi-Level Starlet Optimal Segmentation (MLSOS) were developed to be an alternative for general segmentation tools. These methods gave rise to Jansen-MIDAS, an open-source software. A scientist can use it to obtain several segmentations of hers/his photomicrographs. It is a reliable alternative to process different types of photomicrographs: previous versions of Jansen-MIDAS were used to segment ROI in photomicrographs of two different materials, with an accuracy superior to 89%. (AU)

• Processo FAPESP: 11/09438-3 - Processamento de fotomicrografias por meio da transformada wavelet starlet
• Beneficiário: Alexandre Fioravante de Siqueira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 10/20496-2 - Caracterização de Epídotos via MEV, Espectroscopia Micro-Raman, Calorimetria Diferencial de Varredura e Microscopia Ótica e estudos de annealing e entropia através do Método dos Traços de Fissão
• Beneficiário: Wagner Massayuki Nakasuga
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 07/04952-5 - Preparação e caracterização de membranas de borracha natural com nanopartículas metálicas
• Beneficiário: Flávio Camargo Cabrera
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 09/04962-6 - Estudos de imagens obtidas por microscopias de varredura, força atômica e óptica, utilizando as transformadas de fourier e wavelet
• Beneficiário: Alexandre Fioravante de Siqueira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 10/03282-9 - Membranas de borracha natural recobertas com nanopartículas de ouro: síntese e caracterização
• Beneficiário: Flávio Camargo Cabrera
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado