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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

High performance collision cross section calculationHPCCS

Texto completo
Autor(es):
Zanotto, Leandro [1, 2] ; Heerdt, Gabriel [1, 2] ; Souza, Paulo C. T. [1, 2, 3] ; Araujo, Guido [4, 5] ; Skaf, Munir S. [1, 2]
Número total de Autores: 5
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Estadual Campinas, Inst Chem, BR-13083852 Campinas, SP - Brazil
[2] Univ Estadual Campinas, Ctr Computat Engn & Sci, BR-13083852 Campinas, SP - Brazil
[3] Univ Groningen, Fac Math & Nat Sci, NL-9747 AG Groningen - Netherlands
[4] Univ Estadual Campinas, Inst Comp, BR-13083970 Campinas, SP - Brazil
[5] Univ Estadual Campinas, Ctr Computat Engn & Sci, BR-13083970 Campinas, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 5
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Journal of Computational Chemistry; v. 39, n. 21, p. 1675-1681, AUG 5 2018.
Citações Web of Science: 5
Resumo

Since the commercial introduction of Ion Mobility coupled with Mass Spectrometry (IM-MS) devices in 2003, a large number of research laboratories have embraced the technique. IM-MS is a fairly rapid experiment used as a molecular separation tool and to obtain structural information. The interpretation of IM-MS data is still challenging and relies heavily on theoretical calculations of the molecule's collision cross section (CCS) against a buffer gas. Here, a new software (HPCCS) is presented, which performs CCS calculations using high perfomance computing techniques. Based on the trajectory method, HPCCS can accurately calculate CCS for a great variety of molecules, ranging from small organic molecules to large protein complexes, using helium or nitrogen as buffer gas with considerable gains in computer time compared to publicly available codes under the same level of theory. HPCCS is available as free software under the Academic Use License at . (c) 2018 Wiley Periodicals, Inc. (AU)

Processo FAPESP: 12/24750-6 - Relações entre a obesidade e o receptor TLR4: novos estudos através de simulações de dinâmica molecular
Beneficiário:Paulo Cesar Telles de Souza
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 16/04963-6 - Dinâmica molecular de hidrólise enzimática de celulose e simulações de QM/MM de reações químicas em sistemas biomoleculares
Beneficiário:Gabriel Heerdt
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais
Beneficiário:Munir Salomao Skaf
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs