New Dereplication Method Applied to NMR-Based Metabolomics on Different Fusarium Species Isolated from Rhizosphere of Senna spectabilis

Autor(es)

Denise M. Selegato ^[1] ; Rafael T. Freire ^[2] ; Alberto Tannús ^[3] ; Ian Castro-Gamboa ^[4]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho". Instituto de Química. Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais - Brasil

^[2] Universidade de São Paulo. Instituto de Física. Centro de Imagens e Espectroscopia in vivo por Ressonância Magnética - Brasil

^[3] Universidade de São Paulo. Instituto de Física. Centro de Imagens e Espectroscopia in vivo por Ressonância Magnética - Brasil

^[4] Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho". Instituto de Química. Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais - Brasil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Journal of the Brazilian Chemical Society; v. 27, n. 8, p. 1421-1431, 2016-08-00.

Resumo

The search for new sources of natural products steadily increased the use of bioinformatic tools that enabled efficient analysis of complex matrices. In this context, dereplication methods emerged as a fast way of identifying known compounds, accelerating the identification of bioactive chemotypes. Although 1H NMR is widely used as an analytical technique, few studies have been reported using it as a dereplication tool, primarily because of the spectral complexity. This work aims to create a new computational method that analyses 1H NMR data from Fusarium solani and F. oxysporum isolated from Senna spectabilis's rhizosphere through principal component analysis (PCA). The algorithm uses loading values to select important peaks that distinguish both species in PCA, allowing compound dereplication, even in highly similar profiles. As a result, the method, associated with other NMR experiments and information from an in-house Fusarium's metabolite library was able to distinguish different mycotoxins produced by both fungi, identifying fusaric acid and beauvericin for F. oxysporum and the depsipeptide HA23 from F. solani. (AU)

• Processo FAPESP: 12/22206-7 - Análise metabolômica dos fungos endofíticos associados a Senna spectabilis através de RMN e modelos de desreplicação computacionais
• Beneficiário: Rafael Teixeira Freire
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Processo FAPESP: 11/21623-0 - Desenvolvimento de um Software de Reconhecimento de Padrões e de Desreplicação Aplicado a Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear
• Beneficiário: Rafael Teixeira Freire
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos
• Beneficiário: Glaucius Oliva
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 11/50816-1 - A rizosfera de Senna spectabilis: estudo das interações planta/microrganismos utilizando ferramentas metabolômicas
• Beneficiário: Ian Castro-Gamboa
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular
• Processo FAPESP: 14/05935-0 - Co-cultura de micro-organismos isolados da rizosfera de Senna spectabilis visando a produção de metabólitos bioativos
• Beneficiário: Denise Medeiros Selegato
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto