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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Identification of Hfq-binding RNAs in Caulobacter crescentus

Texto completo
Autor(es):
Assis, Nadine G. [1] ; Ribeiro, Rodolfo A. [1] ; da Silva, Larissa G. [1] ; Vicente, Alexandre M. [1] ; Hug, Isabelle [2] ; Marques, Marilis V. [1]
Número total de Autores: 6
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Inst Ciencias Biomed, Dept Microbiol, Sao Paulo - Brazil
[2] Univ Basel, Biozentrum, Basel - Switzerland
Número total de Afiliações: 2
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: RNA BIOLOGY; v. 16, n. 6 MAR 2019.
Citações Web of Science: 0
Resumo

Small RNAs are important for post-transcriptional regulation of gene expression, affecting stability and activity of their target mRNAs. The bacterial Sm-like protein Hfq is required to promote pairing between both RNAs when their sequence complementarity is limited. To provide a first global view on the post-transcriptional landscape of the alpha-proteobacterium Caulobacter crescentus, we have identified the Hfq-binding RNAs employing High-throughput sequencing of RNA isolated by cross-linking immunoprecipitation (HITS-CLIP). A total of 261 RNAs, including 3 unannotated RNAs, were successfully identified and classified according to putative function. Moreover, possible interactions between the identified sRNAs with mRNA targets were postulated through computational target predictions. (AU)

Processo FAPESP: 16/06378-3 - Caracterização da DEAD box-RNA helicase CC1478 em Caulobacter crescentus e sua regulação
Beneficiário:Rodolfo Alvarenga Ribeiro
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 14/13552-4 - Estudo da RNA helicase da família DEAD-box codificada pelo gene CC0835 em Caulobacter crescentus
Beneficiário:Alexandre Magno Vicente
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 14/04046-8 - Sistemas regulatórios da resposta bacteriana a estresses
Beneficiário:Marilis Do Valle Marques
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 15/21025-7 - Expressão heteróloga da proteína Hfq e obtenção da linhagem FLAG-Hfq com expressão induzida
Beneficiário:Nadine Gimenez de Assis
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica