| Texto completo | |
| Autor(es): |
Camargo, Antonio P.
[1, 2]
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Nakahara, Thiago S.
[3, 1]
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Firmino, Luiz E. R.
[3]
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Netto, Paulo H. M.
[1, 2]
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do Nascimento, Joao B. P.
[3]
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Donnard, Elisa R.
[4]
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Galante, Pedro A. F.
[4]
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Carazzolle, Marcelo F.
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Malnic, Bettina
[3]
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Papes, Fabio
[1]
Número total de Autores: 10
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| Afiliação do(s) autor(es): | [1] Univ Estadual Campinas, Inst Biol, Dept Genet & Evolut, BR-13083862 Campinas, SP - Brazil
[2] Univ Estadual Campinas, Inst Biol, Grad Program Genet & Mol Biol, BR-13083862 Campinas, SP - Brazil
[3] Univ Sao Paulo, Inst Chem, Dept Biochem, BR-05508000 Sao Paulo, SP - Brazil
[4] Hosp Sirio Libanes, Mol Oncol Ctr, BR-01308060 Sao Paulo, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 4
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | DNA Research; v. 26, n. 4, p. 365-378, AUG 2019. |
| Citações Web of Science: | 0 |
| Resumo | |
Very little is known about long non-coding RNAs (lncRNAs) in the mammalian olfactory sensory epithelia. Deciphering the non-coding transcriptome in olfaction is relevant because these RNAs have been shown to play a role in chromatin modification and nuclear architecture reorganization, processes that accompany olfactory differentiation and olfactory receptor gene choice, one of the most poorly understood gene regulatory processes in mammals. In this study, we used a combination of in silico and ex vivo approaches to uncover a comprehensive catalogue of olfactory lncRNAs and to investigate their expression in the mouse olfactory organs. Initially, we used a novel machine-learning lncRNA classifier to discover hundreds of annotated and unannotated lncRNAs, some of which were predicted to be preferentially expressed in the main olfactory epithelium and the vomeronasal organ, the most important olfactory structures in the mouse. Moreover, we used whole-tissue and single-cell RNA sequencing data to discover lncRNAs expressed in mature sensory neurons of the main epithelium. Candidate lncRNAs were further validated by in situ hybridization and RT-PCR, leading to the identification of lncRNAs found throughout the olfactory epithelia, as well as others exquisitely expressed in subsets of mature olfactory neurons or progenitor cells. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 11/22611-6 - Identificação de RNAs não codificadores expressos no epitélio olfatório |
| Beneficiário: | João Batista Placido do Nascimento |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |
| Processo FAPESP: | 16/24471-0 - Receptores olfatórios: mecanismos de expressão gênica e transdução de sinal |
| Beneficiário: | Bettina Malnic |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Temático |
| Processo FAPESP: | 18/11860-4 - Mecanismos epigenéticos de regulação da expressão gênica: o caso dos receptores olfatórios |
| Beneficiário: | Thiago Seike Picoreti Nakahara |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 16/05379-6 - Análise do transcritoma associado a lincRNAs no sistema olfativo acessório |
| Beneficiário: | Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha Camargo |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Processo FAPESP: | 13/08293-7 - CECC - Centro de Engenharia e Ciências Computacionais |
| Beneficiário: | Munir Salomao Skaf |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs |
| Processo FAPESP: | 15/50371-0 - Mecanismos subjacentes ao efeito da experiência social sobre os níveis hormonais, sinalização sensorial e comportamento |
| Beneficiário: | Fabio Papes |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |