Busca avançada
Ano de início
Entree
(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Alternative Splicing of Circadian Clock Genes Correlates With Temperature in Field-Grown Sugarcane

Texto completo
Autor(es):
Dantas, Luiza L. B. [1, 2] ; Calixto, Cristiane P. G. [3] ; Dourado, Maira M. [1] ; Carneiro, Monalisa S. [4] ; Brown, John W. S. [3, 5] ; Hotta, Carlos T. [1]
Número total de Autores: 6
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Inst Quim, Dept Bioquim, Sao Paulo - Brazil
[2] Max Planck Inst Mol Plant Physiol, Potsdam - Germany
[3] Univ Dundee, James Hutton Inst, Sch Life Sci, Div Plant Sci, Dundee - Scotland
[4] Univ Fed Sao Carlos, Dept Biotecnol Prod Vegetal & Anim, Ctr Ciencias Agr, Araras - Brazil
[5] James Hutton Inst, Cell & Mol Sci, Dundee - Scotland
Número total de Afiliações: 5
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: FRONTIERS IN PLANT SCIENCE; v. 10, DEC 23 2019.
Citações Web of Science: 0
Resumo

Alternative Splicing (AS) is a mechanism that generates different mature transcripts from precursor mRNAs (pre-mRNAs) of the same gene. In plants, a wide range of physiological and metabolic events are related to AS, as well as fast responses to changes in temperature. AS is present in around 60% of intron-containing genes in Arabidopsis, 46% in rice, and 38% in maize and it is widespread among the circadian clock genes. Little is known about how AS influences the circadian clock of C4 plants, like commercial sugarcane, a C4 crop with a complex hybrid genome. This work aims to test if the daily dynamics of AS forms of circadian clock genes are regulated by environmental factors, such as temperature, in the field. A systematic search for AS in five sugarcane clock genes, ScLHY, ScPRR37, ScPRR73, ScPRR95, and ScTOC1 using different organs of sugarcane sampled during winter, with 4 months old plants, and during summer, with 9 months old plants, revealed temperature- and organ-dependent expression of at least one alternatively spliced isoform in all genes. Expression of AS isoforms varied according to the season. Our results suggest that AS events in circadian clock genes are correlated with temperature. (AU)

Processo FAPESP: 15/10220-3 - Revelando as relações entre relógio biológico, splicing alternativo e metabolismo da cana-de-açúcar
Beneficiário:Luíza Lane de Barros Dantas
Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Processo FAPESP: 15/06260-0 - Relógios biológicos específicos em órgãos e tecidos de gramíneas C4
Beneficiário:Carlos Takeshi Hotta
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
Processo FAPESP: 11/00818-8 - Desenvolvimento de modelos biológicos alternativos para o estudo de redes de regulação em cana-de-açúcar
Beneficiário:Carlos Takeshi Hotta
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 11/08897-4 - Caracterização do relógio biológico e seu impacto no metabolismo da cana-de-açúcar
Beneficiário:Luíza Lane de Barros Dantas
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado