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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Replication origin location might contribute to genetic variability in Trypanosoma cruzi

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Autor(es):
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de Araujo, Christiane Bezerra [1, 2] ; Chagas da Cunha, Julia Pinheiro [1, 2] ; Inada, Davi Toshio [1, 2] ; Damasceno, Jeziel [3] ; Jeronimo Lima, Alex Ranieri [4] ; Hiraiwa, Priscila [5] ; Marques, Catarina [3] ; Goncalves, Evonnildo [4] ; Nishiyama-Junior, Milton Yutaka [6, 1] ; McCulloch, Richard [3] ; Elias, Maria Carolina [1, 2]
Número total de Autores: 11
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Inst Butantan, Ctr Toxins Immune Response & Cell Signaling CeTIC, Sao Paulo - Brazil
[2] Inst Butantan, Lab Ciclo Celular, Sao Paulo - Brazil
[3] Univ Glasgow, Inst Infect Immun & Inflammat, Wellcome Ctr Mol Parasitol, Glasgow, Lanark - Scotland
[4] Univ Fed Para, Lab Tecnol Biomol Bioinformat, Inst Ciencias Biol, Belem, Para - Brazil
[5] Inst Carlos Chagas, Fundacao Oswaldo Cruz, Curitiba, Parana - Brazil
[6] Inst Butantan, Lab Especial Toxinol Aplicada, Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 6
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: BMC Genomics; v. 21, n. 1 JUN 22 2020.
Citações Web of Science: 0
Resumo

BackgroundDNA replication in trypanosomatids operates in a uniquely challenging environment, since most of their genomes are constitutively transcribed. Trypanosoma cruzi, the etiological agent of Chagas disease, presents high variability in both chromosomes size and copy number among strains, though the underlying mechanisms are unknown.ResultsHere we have mapped sites of DNA replication initiation across the T. cruzi genome using Marker Frequency Analysis, which has previously only been deployed in two related trypanosomatids. The putative origins identified in T. cruzi show a notable enrichment of GC content, a preferential position at subtelomeric regions, coinciding with genes transcribed towards the telomeres, and a pronounced enrichment within coding DNA sequences, most notably in genes from the Dispersed Gene Family 1 (DGF-1).ConclusionsThese findings suggest a scenario where collisions between DNA replication and transcription are frequent, leading to increased genetic variability, as seen by the increase SNP levels at chromosome subtelomeres and in DGF-1 genes containing putative origins. (AU)

Processo FAPESP: 13/07467-1 - CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular
Beneficiário:Hugo Aguirre Armelin
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
Processo FAPESP: 14/24170-5 - Dinâmica da replicação do DNA em Trypanosoma cruzi: caracterização do licenciamento e da taxa de replicação
Beneficiário:Marcelo Santos da Silva
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 16/50050-2 - How do common and diverged features of the replicative stress response shape the biology of TriTryp parasites?
Beneficiário:Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 14/13375-5 - Origens da replicação em tripanossomas
Beneficiário:Christiane Bezerra de Araujo
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado