| Texto completo | |
| Autor(es): |
Lopes, Vitor Galvao
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de Oliveira, Victor Fernandes
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Dati, Livia Mendonca Munhoz
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Naslavsky, Michel Satya
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Ferreira, Glaucio Monteiro
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Hirata, Mario Hiroyuki
Número total de Autores: 6
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS; v. N/A, p. 9-pg., 2023-03-25. |
| Resumo | |
The Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9 (PCSK9) promotes the degradation of the low-density lipoprotein receptors (LDLR). Gain-of-function (GOF) variants of PCSK9 significantly affects lipid metabolism leading to coronary artery disease (CAD), owing to the raising the plasma low-density lipoprotein (LDL). Considering the public health matter, large-scale genomic studies have been conducted worldwide to provide the genetic architecture of populations for the implementation of precision medicine actions. Nevertheless, despite the advances in genomic studies, non-European populations are still underrepresented in public genomic data banks. Despite this, we found two high-frequency variants (rs505151 and rs562556) in the ABraOM databank (Brazilian genomic variants) from a cohort SABE study conducted in the largest city of Brazil, Sao Paulo. Here, we assessed the structural and dynamical features of these variants against WT through a molecular dynamics study. We sought fundamental dynamical interdomain relations through Perturb Response Scanning (PRS) and we found an interesting change of dynamical relation between prodomain and Cysteine-Histidine-Rich-Domain (CHRD) in the variants. The results highlight the pivotal role of prodomain in the PCSK9 dynamic and the implications for the development of new drugs depending on patient group genotype. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 21/11205-9 - Desenvolvimento de novos fármacos baseados na estrutura de proteínas essenciais para síntese e metabolismo do colesterol, integrando estudos genéticos e modelagem molecular de pacientes dislipidêmicos |
| Beneficiário: | Glaucio Monteiro Ferreira |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 16/12899-6 - Caracterização genômica, epigenômica e farmacogenômica de portadores de hipercolesterolemia familial na população brasileira |
| Beneficiário: | Mario Hiroyuki Hirata |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Temático |
| Processo FAPESP: | 18/11917-6 - Desenvolvimento de um "pipeline" específico de bioinformática |
| Beneficiário: | Victor Fernandes de Oliveira |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Processo FAPESP: | 20/06490-3 - Busca por novos inibidores da PCSK9 empregando técnicas de planejamento de fármacos baseado na estrutura do alvo |
| Beneficiário: | Vitor Galvão Lopes |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Iniciação Científica |