Busca avançada
Ano de início
Entree


Mapping the IscR regulon sheds light on the regulation of iron homeostasis in Caulobacter

Texto completo
Autor(es):
dos Santos, Naara M. ; Picinato, Beatriz A. ; Santos, Lucas S. ; de Araujo, Hugo L. ; Balan, Andrea ; Koide, Tie ; Marques, Marilis V.
Número total de Autores: 7
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: FRONTIERS IN MICROBIOLOGY; v. 15, p. 18-pg., 2024-09-30.
Resumo

The role of the iron-sulfur [Fe-S] cluster transcriptional regulator IscR in maintaining [Fe-S] homeostasis in bacteria is still poorly characterized in many groups. Caulobacter crescentus and other Alphaproteobacteria have a single operon encoding [Fe-S] cluster biosynthesis enzymes. We showed that the expression of this operon increases in iron starvation, but not in oxidative stress, and is controlled mainly by IscR. Transcriptome analysis comparing an iscR null mutant strain with the wild-type (wt) strain identified 94 differentially expressed genes (DEGs), with 47 upregulated and 47 downregulated genes in the Delta iscR mutant. We determined the IscR binding sites in conditions of sufficient or scarce iron by Chromatin Immunoprecipitation followed by DNA sequencing (ChIP-seq), identifying two distinct putative DNA binding motifs. The estimated IscR regulon comprises 302 genes, and direct binding to several regulatory regions was shown by Electrophoresis Mobility Shift Assay (EMSA). The results showed that the IscR and Fur regulons partially overlap and that IscR represses the expression of the respiration regulator FixK, fine-tuning gene regulation in response to iron and redox balance. (AU)

Processo FAPESP: 21/10577-0 - Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos (CEPID B3)
Beneficiário:Shaker Chuck Farah
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
Processo FAPESP: 22/00308-4 - Identificação e comparação de RNAs circulares em dados de transcritoma de arqueias
Beneficiário:Beatriz Adas Picinato
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Processo FAPESP: 20/10171-0 - Estudos mecanísticos da captação e regulação de fosfato: a estreita relação entre um transportador de cassete de ligação de ATP e um sistema dois-componentes
Beneficiário:Lucas Souza dos Santos
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Processo FAPESP: 22/06360-8 - Caracterização de novos circuitos regulatórios de expressão gênica em Alfaproteobactérias
Beneficiário:Marilis Do Valle Marques
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 18/17309-8 - Estudo do papel da RNA helicase RhlB da família DEAD-box na estabilidade dos RNAs e na expressão gênica em Caulobacter crescentus
Beneficiário:Hugo Libonati de Araújo
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado