Plant Sample Preparation for Metabolomics, Lipidomics, Ionomics, Fluxomics, and Peptidomics

Autor(es)

da Silva, Walace Breno ; Hispagnol, Gabriel Felipe ; Nunes, Emanuel Victor dos Santos ; Castro-Gamboa, Ian ; Pilon, Alan Cesar

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SEPARATIONS; v. 12, n. 2, p. 21-pg., 2025-02-01.

Resumo

Plant metabolomics, lipidomics, ionomics, fluxomics, and peptidomics are essential approaches for exploring how plants respond to epigenetic, pathological, and environmental stimuli through comprehensive chemical profiling. Over the past decades, significant progress has been made in protocols and methodologies to address the challenges in sample collection and extraction. Despite these advancements, sample preparation remains intricate, with ongoing debates about the most effective strategies. This review emphasizes the importance of clear research questions and well-designed experiments to minimize complexity, save time, and enhance reproducibility. It provides an overview of the key steps in these fields, including harvesting, drying, extraction, and data pre-acquisition for major analytical platforms. By discussing best practices and common challenges, this review aims to streamline methods and promote more consistent and reliable research outcomes. (AU)

• Processo FAPESP: 19/15889-0 - Uso de bases de dados de produtos naturais e traços foliares combinado a mineração de dados para modelagem das funções e evolução dos metabólitos secundários em angiospermas
• Beneficiário: Alan Cesar Pilon
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 20/02207-5 - Inventariando o metabolismo secundário através da metabolômica: contribuição para a valoração da biodiversidade brasileira
• Beneficiário: Norberto Peporine Lopes
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
• Processo FAPESP: 14/50926-0 - INCT 2014: biodiversidade e produtos naturais
• Beneficiário: Vanderlan da Silva Bolzani
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
• Processo FAPESP: 20/11967-3 - Uso sustentável da biodiversidade brasileira: aplicação de dados vinculados para a descoberta de produtos naturais
• Beneficiário: Vanderlan da Silva Bolzani
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular