Development and characterization of microsatellite markers for Brazilian four-eyed frogs (genus Pleurodema) endemic to the Caatinga biome

Autor(es)

Thome, M. T. C. ^[1] ; Alexandrino, J. ^[2] ; Lopes, S. ^[3] ; Haddad, C. F. B. ^[1] ; Sequeira, F. ^[3]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Estadual Paulista, Inst Biociencias, Dept Zool, Rio Claro, SP - Brazil

^[2] Univ Fed Sao Paulo, Dept Ciencias Biol, Diadema, SP - Brazil

^[3] Univ Porto, Ctr Invest Biodiversidade & Recursos Genet, Vairao - Portugal

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Genetics and Molecular Research; v. 13, n. 1, p. 1604-1608, 2014.
• Citações Web of Science: 1

Resumo

We used pyrosequencing to develop microsatellite markers for the Brazilian four-eyed frog Pleurodema diplolister and tested the microsatellite markers for cross-amplification in its sister Pleurodema alium, which are both endemic species of the Caatinga biome in northeastern Brazil. We used multiplex sets to amplify and genotype 30 individuals of P. diplolister from three different populations and 10 individuals of P. alium from a single population. We successfully amplified 24 loci for P. diplolister, 13 of which we were able to amplify in P. alium. All loci were polymorphic. Significant deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium and the presence of null alleles were only consistently detected at one locus (Pleu9). These markers will enable the study of geographic genetic diversity and evolutionary processes in these two Caatinga endemics, and the inclusion of genetic data for conservation planning of the Caatinga biome. (AU)

• Processo FAPESP: 12/50255-2 - Filogeografia de anfibios comuns em regioes pouco estudadas do brasil:a caatinga e a regiao subtropical.
• Beneficiário: João Miguel de Barros Alexandrino
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 12/06611-9 - A história da caatinga: mapeando padrões genéticos e processos evolutivos em uma espécie endêmica através de marcadores de evolução rápida
• Beneficiário: Maria Tereza Chiarioni Thomé
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 08/50928-1 - Especiação de anfíbios anuros em ambientes de altitude
• Beneficiário: Célio Fernando Baptista Haddad
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático