A structural biology laboratory network for the study of the 3D structures of proteins

Resumo

Propomos elucidar a estrutura de proteínas que: I) tenham potencial relevância na indução ou manutenção de um fenótipo maligno em humanos; II) sejam funcionalmente relevantes em plantas e bactérias. Para algumas dessas proteínas será feito um esforço para determinar estruturas que revelem lamentos inéditos; III) exibam alto potencial de terem suas estruturas determinadas por cristalografia de proteínas com luz síncrotron ou por espectroscopia de ressonância ética nuclear multidimensional. A escolha dessas proteínas será baseada principalmente nos resultados dos Programas Genoma da FAPESP, Xylella fastidiosa, xanthommonas citri, Cana-EST e Câncer Humano-EST. Estes programas produziram uma enorme quantidade de informação que precisa ser explorada do ponto de vista funcional e estrutural. O conhecimento das estruturas destas proteínas permitiria abrir um atraente cenário, o do desenho racional de inibidores de atividade de proteínas, isto é, potenciais medicamentos no caso do câncer e pesticidas e herbicidas nos outros casos. Em paralelo estamos propondo organizar a Rede de Biologia Estrutural do Estado de São Paulo, que pretende aumentar o fluxo de proteínas a serem analisadas e expandir o número de grupos, no Estado de São Paulo, envolvidos na área de Biologia Estrutural. Os programas Genomas da FAPESP tem sido de enorme importância para aumentar significativamente o número de pesquisadores com experiência em sequenciamento de DNA e anotação. Um desenvolvimento adicional em biologia molecular envolve um aumento de capacidade em determinação de estrutura de proteínas, o qual, por sua vez requer competência em expressão e purificação de proteínas. Todos estes aspectos são centrais no presente projeto. A criação de uma Rede de laboratórios é crítica para o alcance para o alcance destas metas. Será requerido que os membros dos laboratórios associados procurem desenvolver interesse e habilidade na área de biologia estrutural. Dessa forma, espera-se que eles operem tentando cristalizar proteínas, coletar dados de difração ou determinar estrutura de proteínas em solução por ressonância nuclear magnética. (AU)