Cristalografia, modelagem molecular e planejamento de substâncias de interesse biológico II

• Processo: 94/00587-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de julho de 1995 - 31 de outubro de 1998
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Glaucius Oliva
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Auxílios(s) vinculado(s): 99/04543-0 - Molecular model for the km+ lectin from jackfruit (artocarpus intergrifolia)., AR.EXT; 98/01855-8 - Don C. Wiley | Howard Medical Institute - Estados Unidos, AV.EXT; 96/04158-0 - Protein crystallography station at lnls., AR.EXT; 96/01558-8 - Molecular modelling of s.mansoni and f.hepatica fatty-acid binding proteins and its relevance to the development of a dual purpose anti-helminth vaccine., AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 98/01921-0 - Caracterizacao e estudos estruturais da enzima hipoxantina-guanina-fosforribosil-transferase e leishmania tarentolae., BP.PD; 97/06681-5 - Sintese de inibidores da enzima gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase glicossomal de trypanosoma cruzi envolvidos no planejamento racional de drogas anti-chagasicas baseado em estruturas., BP.DR; 97/06680-9 - Desenvolvimento de novas drogas anti-chagasicas: sintese de potenciais inibidores de gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase (ggapdh)., BP.PD; + mais bolsas vinculadas 97/01904-6 - Drogas antichagasicas tendo como alvo a enzima gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase de trypanosoma cruzi: triagem de produtos naturais na busca de compostos de partida e otimizacao por planejamento baseado..., BP.PD; 96/01197-5 - Cristalização e determinação da estrutura do complexo troponina C/Troponina I (TnC/TnI) do músculo estriado por técnicas de difração de raios-x, BP.PD; 96/01188-6 - Estudos estruturais de endopeptidase glutamato-específica de Bacillus licheniformis, BP.MS - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Cristalografia Modelagem molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cristalografia | Estrutura De Proteina | Modelagem Molecular

Resumo

Com o objetivo de analisar estruturas macromoleculares com resolucão atômica e utilizando-se as técnicas de Cristalografia de Proteínas (Cristalização e determinação de estruturas tridimensionais macromoleculares com detalhe atômico por difração de raios-X em monocristais) e Modelagem Molecular (análise de sequências protêicas e gênicas, modelagem estrutural por homologia, planejamento racional de drogas e inibidores), complementadas com a análise de características estruturais de proteínas por Técnicas Espectroscópicas (Dicroismo Circular, Fluorescência, EPR, Infra-vermelho), e apoiadas por excelentes facilidades de Bioquímica e Biologia Molecular, este projeto visa: (1) planejamento racional de inibidores específicos da GAPDH de T. cruzi baseado na sua estrutura tridimensional; (2) preparação do mutante D210L de GAPDH de T.cruzi e sua expressão, purificação, caracterização de cinética enzimática e estrutural; (3) Lectina de Cratylia mollis (feijão camaratu); (4) Fosfolipase A2 de Bothorps moojeni; (5) fosfolipase tipo K49 de Bothrops jararacussu; (6) glucosamina-6-fosfato desaminase de E.coli e seus mutantes; (7) proteínas antigênicas de S.mansoni; (8) inibidor de a-amilase extraído de grão de trigo (Triticum aestivum); (9) calgranulina C de granulócitos porcinos; (10) lectina KM+ de Artocarpus integrifolia (jaca); (11) catecol 1,2-dioxigenase de Pseudomonas putida e Alcaligenes eutrophus; (12) complexo Troponina C/I de músculo de galinha, com proteína obtida por via recombinante em E.coli; (13) thi1, um gene de Arabidopsis thaliana envolvido na biossíntese de tiaminas e com possível participação em processos de reparo de DNA in vivo; (14) delta-endotoxina de Bacillus thuringiensis; (15) superóxido dismutase de protistas patogênicos; (16) endopeptidase glutamato específica de B. licheniformis; (17) adenina fosforibosil transferase de Leishmania tarantolae; (18) transialidase de Trypanosoma cruzi. (AU)