Proposição dos modelos de expansão intragenômica dos elementos transponíveis 412, F e Bari em Drosophila melanogaster e D. simulans e análise de fatores que possam interferir na dinâmica de transposição

Resumo

O método de Median Joining Network tem sido utilizado para análise das relações entre as cópias de famílias e de subfamílias de elementos transponíveis por mostrar-se adequado para analisar relações evolutivas de sequências intraespecíficas que apresentam baixa divergência. O presente estudo tem como objetivo analisar o modelo de expansão dos elementos transponíveis 412, F e Bari (1 e 2) em D. melanogaster e D. simulans, de modo a caracterizá-los dentro dos modelos "master copy", "transposon" ou "intermediário" por meio de uma análise de Median Joining Network. Para isso, será realizada uma análise in sílico para identificar os elementos transponíveis 412, F e Bari nos genomas sequenciados de D. melanogaster e D. simulans. Essas sequências serão alinhadas e agrupadas com o auxílio da ferramenta Network, resultando na obtenção do modelo de expansão das sequências de TEs de cada família, em cada espécie. Também serão realizadas análises moleculares (amplificação, clonagem e sequenciamento) em linhagens oriundas de populações naturais, ancestrais, anciãs e invasoras, das duas espécies para obter as seqüências desses elementos, que serão alinhadas e agrupadas para análise do modelo de expansão. Além de permitir propor o modelo de expansão intragenômica desses elementos, este estudo propiciará elementos para avaliar se fatores intrínsecos aos elementos (sub-classe a que pertencem, proporção total de elementos no genoma, número de inserções específico do elemento estudado), das espécies (tamanho do genoma, tamanho populacional, estado ancestral, ancião ou colonizador) e do ambiente (temperatura) interferem nessa dinâmica. (AU)