Efeitos da seleção genômica em populações simuladas de aves poedeiras

Resumo

A seleção genômica é uma forma de seleção assistida por marcadores do tipo SNP (polimorfismos de nucleotídeos únicos), que em desequilíbrio de ligação explora potencialmente todos os loci de características quantitativas do genoma. A herdabilidade, o tamanho do genoma, o tamanho efetivo da população e o nível de endogamia podem alteram a acurácia dos valores genômicos diretos. O valor genético obtido da informação dos efeitos estimados dos marcadores é chamado de valor genômico direto, enquanto que a combinação deste com o valor genético estimado é chamada de valor genético genômico. No presente trabalho, o objetivo será estimar valor genético e valor genômico direto e a correlação entre ambos (acurácia) para dados fenotípicos e genotípicos, simulados com estrutura de desequilíbrio de ligação para uma linhagem de aves poedeiras da raça White Leghorn. Os cenários de simulação incluem características com herdabilidades distintas (produção e peso dos ovos) e diferentes níveis de endogamia. Dois cenários serão criados a partir de uma população histórica simulada a fim de gerar histórico de desequilíbrios de ligação e deriva genética. Em cada cenário, as características taxa de postura total, da 17ª a 70ª semana de idade e o peso dos ovos as 32 semanas de idade serão simuladas. O sistema de acasalamento será distinto quanto à taxa de endogamia, sendo em um deles aleatório (sem controle de endogamia) e em outro minimizando a endogamia. O valor genético verdadeiro de cada indivíduo será considerado como a somatória dos efeitos aditivos dos QTL, resultantes da simulação. Os valores genéticos estimados serão obtidos por máxima verossimilhança restrita. Um modelo de regressão de cumeeira será usado para estimar os efeitos dos marcadores SNP no cálculo do valor genômico direto. O coeficiente de correlação de Spearman entre os valores genômicos diretos e verdadeiros e as acurácias serão utilizados para comparação dos cenários simulados.