| Processo: | 13/12162-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado |
| Data de Início da vigência: | 16 de setembro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 15 de março de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética |
| Pesquisador responsável: | Diogo Meyer |
| Beneficiário: | Débora Yoshihara Caldeira Brandt |
| Supervisor: | Jérôme Goudet |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Université de Lausanne (UNIL), Suíça |
| Vinculado à bolsa: | 12/22796-9 - Diferenciação populacional em genes sob forte seleção balanceadora: um estudo de caso com genes HLA, BP.MS |
| Assunto(s): | Genética populacional Diversidade genética Evolução molecular |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Diferenciação Populacional | evolução molecular | seleção balanceadora | Simulação | Genética de populações |
Resumo A seleção balanceadora é um processo evolutivo importante, pois contribui para a manutenção da diversidade genética em populações. Diferentes mecanismos não mutuamente exclusivos são propostos para a seleção balanceadora. Entre eles, vantagem de heterozigotos, seleção dependente de frequência e seleção flutuante. Todos esses mecanismos podem explicar a alta diversidade encontrada nos genes HLA (do inglês, Human Leucocyte Antigen), que são o exemplo mais clássico de alvo de seleção balanceadora no genoma humano. Neste trabalho, propomos uma análise de diferenciação populacional nos genes HLA. Nossa expectativa é que essa análise será informativa sobre o mecanismo de ação da seleção balanceadora nesses genes e sobre o efeito da seleção balanceadora sobre a diferenciação entre populações. Especificamente, testaremos duas possibilidades contrastantes sobre o efeito da seleção balanceadora nos genes HLA para a diferenciação entre populações: (a) a seleção tem como resultado a manutenção de polimorfismos compartilhados entre populações, o que reduz a diferenciação; (b) a seleção tem como resultado o aumento na frequência de variantes localmente adaptativas, o que aumenta a diferenciação. Para isso, analisaremos dados de SNPs identificados em diferentes populações humanas, comparando a diferenciação populacional de SNPs localizados próximos a genes HLA à de SNPs em outras regiões do genoma. Usaremos também simulações para comparar diferentes cenários de seleção balanceadora em relação a seus efeitos sobre a diferenciação populacional. (AU) | |
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