Análise de componentes do metabolismo energético ao longo do crescimento em cultura de Arcella intermedia

Resumo

O crescimento microbiano é um processo complexo que envolve inúmeras reações metabólicas que resultam em divisão celular. As curvas de crescimento típico têm 4 fases: lag, log, estacionária e declínio. Arcella intermedia não parece seguir exatamente esse mesmo padrão de crescimento. In vitro, o crescimento celular depende de vários fatores, como o pH,Temperatura, osmolalidade, concentração de gás, substratos de superfície disponíveis e estado deAs células na inoculação. Durante o cultivo in vitro de células animais, qualquer mudança das condições ambientais ideais pode resultar em uma rápida diminuição da viabilidade da célula. Todas as células vivas "trabalham", e para fazer esses trabalhos a célula precisa de energia.As vias metabólicas são reguladas em vários níveis dentro da célula. E já foi mostrado que essas regulações são muito variáveis em protistas. Com RNAseq podemos identificar genes e transcritos ativos nas células. Isso é útil paraIdentificar genes expressos diferencialmente, que devem estar respondendo a sinais do meio ambiente. Neste projeto, pretendemos investigar as modificações do metabolismo energetico em toda a linhagem do crescimento de amebas. Nós já geramos dados do transcriptoma (RNAseq). Nós vamosFazer uma análise computacional para extrair genes relacionados ao metabolismo e tentar compreender seu padrão de expressão ao longo da curva de crescimento da ameba. Pretendo fazer isso no decorrer de um mês. (AU)