Investigação global de número de cópias em DNA livre circulante no teste pré-natal não invasivo

Resumo

A introdução de um teste utilizando DNA livre para o rastreamento das aneuploidias fetais mais comuns (trissomias 21, 18 e 13) impactou de maneira significativa o diagnóstico pré-natal e vem mudando rapidamente o padrão de atendimento na área de obstetrícia. O termo NIPT (do inglês, Non-Invasive Prenatal Testing) se popularizou e atualmente é utilizado para se referir a este tipo de teste. Apesar de existirem outras metodologias que também podem ser aplicadas no NIPT, o sequenciamento massivo paralelo com base na contagem de reads tornou-se o método de escolha em diversos centros médicos no mundo todo, e a maioria dos estudos de validação clínica do NIPT são provenientes dessa abordagem. No entanto, como não é feita nenhuma distinção entre as sequências materna e fetais nos dados gerados do sequenciamento, e considerando que a maior fração de DNA livre circulante no plasma corresponde à fragmentos de DNA de origem materna ao invés de fetal, desequilíbrios genômicos no genoma materno geralmente desviam os parâmetros estatísticos e, consequentemente, impactam a acurácia na detecção das trissomias fetais. Embora este não seja o principal objetivo do NIPT, diversos estudos demonstram que a análise e a interpretação das variações do número de cópias de DNA materno (CNVs) são muito importantes porque algumas CNVs podem ser de fato achados clinicamente relevantes. Um exemplo é a identificação de câncer materno pré-sintomático a partir dos resultados de NIPT. Contudo, as CNVs maternas relatadas até o presente no NIPT correspondem a eventos grandes, e as análises não estão interrogando CNVs menores com potencial clínico relevante. Sendo assim, o objetivo principal deste projeto é investigar os limites de sensibilidade na detecção precisa de alterações do número de cópias maternas a partir de resultados do NIPT. De maneira importante, o conhecimento adquirido neste projeto poderá ser aplicado à uma série de situações clínicas e de pesquisa que envolvem a estimativa de variação no número de cópias e eventos de mosaicismo.