Diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho e estudos genômicos virais

• Processo: 18/00837-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2018 - 31 de maio de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Valor Concedido/Desembolsado (R$): 211.481,47 / 211.481,47
• Pesquisador responsável: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Beneficiário: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ana de Lourdes Candolo Martinelli ; Aparecida Yulie Yamamoto ; Marcia Guimarães Villanova ; William Marciel de Souza
• Assunto(s): Arbovirus Epidemiologia molecular Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arbovírus | Epidemiologia Molecular | Genomica viral | Hepatites virais | Virologia humana | Vírus zoonóticos | Virologia

Resumo

Os sequenciadores de alto desempenho tem permitido importantes avanços na identificação e caracterização de vírus, sem a necessidade de isolamento e cultivo celular. Além disso, os custos do uso destes sequenciadores tem sido drasticamente reduzidos nos últimos anos, tornando, este método cada vez mais utilizado em estudos com vírus de importância para a saúde pública humana. Por isso, explorando amplamente esta metodologia, pretendemos utilizar a plataforma MinION, para realizar sequenciamento visando ao diagnóstico viral em etapa única e com direto fornecimento da sequência nucleotídica. Para tanto, desenvolveremos painéis para arbovírus e hepatites virais causadores de doença humana, e também para vírus que acometem o sistema nervoso central e pacientes imunossuprimidos. Estas abordagens diagnósticas com sequenciamento MinION poderão ser implementadas na rotina clínica, patenteadas e disponibilizadas em kits diagnósticos comerciais. Deste modo, este projeto irá fornecer importantes informações para o diagnóstico, caracterização genômica, taxonomia, evolução e epidemiologia molecular, bem como tentaremos o isolamento viral de importância clínica humana. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SILVA DE LIMA, SHIRLENE TELMOS; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; CAVALCANTE, JOHN WASHINGTON; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CARRERA, JEAN-PAUL; SIMOES MELLO, LEDA MARIA; DE CARVALHO ARAUJO, FERNANDA MONTENEGRO; CAVALCANTE RAMALHO, IZABEL LETICIA; DE ALMEIDA BARRETO, FRANCISCA KALLINE; et al. Fatal Outcome of Chikungunya Virus Infection in Brazil. Clinical Infectious Diseases, v. 73, n. 7, p. E2436-E2443, OCT 1 2021. (18/00837-1, 17/13981-0, 18/09383-3, 19/24251-9)