Diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho e estudos genômicos virais

• Processo: 18/00837-1
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2018 - 31 de maio de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Beneficiário: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesq. associados: Ana de Lourdes Candolo Martinelli ; Aparecida Yulie Yamamoto ; Marcia Guimarães Villanova ; William Marciel de Souza
• Assunto(s): Arbovirus Epidemiologia molecular Virologia

Resumo

Os sequenciadores de alto desempenho tem permitido importantes avanços na identificação e caracterização de vírus, sem a necessidade de isolamento e cultivo celular. Além disso, os custos do uso destes sequenciadores tem sido drasticamente reduzidos nos últimos anos, tornando, este método cada vez mais utilizado em estudos com vírus de importância para a saúde pública humana. Por isso, explorando amplamente esta metodologia, pretendemos utilizar a plataforma MinION, para realizar sequenciamento visando ao diagnóstico viral em etapa única e com direto fornecimento da sequência nucleotídica. Para tanto, desenvolveremos painéis para arbovírus e hepatites virais causadores de doença humana, e também para vírus que acometem o sistema nervoso central e pacientes imunossuprimidos. Estas abordagens diagnósticas com sequenciamento MinION poderão ser implementadas na rotina clínica, patenteadas e disponibilizadas em kits diagnósticos comerciais. Deste modo, este projeto irá fornecer importantes informações para o diagnóstico, caracterização genômica, taxonomia, evolução e epidemiologia molecular, bem como tentaremos o isolamento viral de importância clínica humana. (AU)