Estudo de associação genômica e análise funcional de características de conformação de pernas e pés em bovinos Nelore

• Processo: 18/25428-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Danísio Prado Munari
• Beneficiário: Danísio Prado Munari
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Jaboticabal
• Assunto(s): Bos taurus indicus Pecuária de corte
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beef cattle | Bos taurus indicus | Candidate Genes | weighted single step | Melhoramento Genético de bovinos de corte

Resumo

Conformação de pernas e pés é avaliada como um subconjunto de características de estrutura conformacional em bovinos de leite e de corte e está relacionada à qualidade dos pés e pernas que podem comprometer o desempenho produtivo e a longevidade dos animais. O objetivo deste estudo foi realizar um estudo de associação genômica ampla (GWAS) para duas características relacionadas a conformação de pernas e pés em bovinos da raça Nelore na tentativa de identificar regiões cromossômicas relacionadas à expressão dessas características. Foram utilizados dados fenotípicos de de 104.725 animais. Destes, foram genotipados 1.435 animais (407.730 SNPs). A conformação de pernas e pés foi avaliada em escala binária (FL1) na tentativa de identificar animais com problemas de pernas e pés, ou como uma característica categórica (FL2) para avaliar a qualidade geral da estrutura de pernas e pés. As top dez janelas de 1-Mb que explicaram a maior proporção da variância genética foram identificadas para posterior análise de enriquecimento funcional. As 10 janelas com os maiores efeitos obtidos para FL1 estão localizadas nos cromossomos 1, 2, 6, 7, 8, 10, e 14, e juntas explicam 8.96% das variância genética aditiva. Para FL2, estas janelas estão localizadas nos cromossomos 1, 7, 10, 11, 18, 20, 22, 28, e 29, explicando 8.98% da variância genética aditiva. Foram identificados importantes genes candidatos, incluindo o gene DLX2 o qual está associado à diferenciação osteogênica, os genes IL-1² e IL-1A associados a algumas propriedades da cartilagem articular, o gene PiT1 o qual desempenha um papel importante na fisiologia óssea, e o gene CTSL associada à artrite reumatóide. Os resultados aqui apresentados devem contribuir para uma melhor compreensão dos mecanismos genéticos e fisiológicos que regulam as duas características, e identifica genes candidatos para futura investigação de mutações causais. (AU)