Interação microbioma-hospedeiro: prospecção e validação de biomarcadores de interesse agropecuário e descoberta de alvos terapêuticos em bovinos

• Processo: 22/06281-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Projeto Geração
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2028
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Tainã Figueiredo Cardoso
• Beneficiário: Tainã Figueiredo Cardoso
• Instituição Sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). São Carlos , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Carlos
• Pesquisadores associados: Adhemar Zerlotini Neto ; Alessandro Pelegrine Minho ; Aline Silva Mello Cesar ; Bruno Gabriel Nascimento Andrade ; Emilio Mármol Sánchez ; Gerson Barreto Mourão ; Juliano Coelho da Silveira ; Luciana Correia de Almeida Regitano ; Luiz Lehmann Coutinho ; Marcos Roberto Chiaratti ; Patricia Tholon ; Sergio Raposo de Medeiros ; Teresa Cristina Alves ; Wellison Jarles da Silva Diniz ; Yuliaxis Ramayo Caldas
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/28669-9 - Interactoma hospedeiro-microbioma de microrganismos candidatos associados a fenótipos de interesse em diferentes raças bovinas, BP.IC; 25/28154-9 - Identificação do msRNA microbiano e sua interação com os genes do hospedeiro., BP.IC; 23/10717-1 - Interação microbioma-hospedeiro: prospecção e validação de biomarcadores de interesse agropecuário e descoberta de alvos terapêuticos em bovinos, BP.GR
• Assunto(s): Genética animal Bovinos Vesículas extracelulares Proteínas Interactoma RNA interferente pequeno RNAs não codificadores Biomarcadores Alvo terapêutico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cattle | extracellular vesicles | interactome | proteins | small RNA | Genética Animal

Resumo

Duas características cruciais da pecuária são a eficiência alimentar (EA) e a emissão de metano entérico (EM) dos animais. Estudos utilizando diferentes tecnologias ômicas relataram que a microbiota ruminal pode promover variações fenotípicas no hospedeiro a curto e longo prazo. Existem muitas teorias possíveis para a comunicação interespécies entre a microbiota e as células hospedeiras, como por meio de proteínas, RNA e metabólitos, que podem ser transportados por todo o corpo do hospedeiro por meio de vesículas extracelulares (EVs). Pequenos RNAs não codificantes (sRNAs), como os microRNAs (miRNAs), representam candidatos promissores a uma "linguagem comum" entre as espécies, pois são produzidos por todos os organismos vivos e podem ser transportados por todo o corpo do hospedeiro por EVs. Estudos recentes sugerem que os miRNAs podem regular a expressão gênica bacteriana e, assim, influenciar a composição do microbioma. Além disso, as observações de estudos suportam a existência de RNAs em organismos procarióticos semelhantes aos miRNAs (msRNAs), capazes de regular a expressão gênica do hospedeiro. Nossa hipótese é que o hospedeiro pode regular sua microbiota através da ação de elementos reguladores (como miRNAs) e da interação entre genes, assim como os microrganismos podem regular várias vias metabólicas do hospedeiro por meio de msRNA e proteínas específicas. Além disso, levantamos a hipótese de que os EVs podem transportar esses mediadores primários nas comunicações microbiota-hospedeiro. Assim, os objetivos desta proposta de pesquisa são: (1) investigar a interação e regulação molecular entre o hospedeiro e candidatos microbianos associados à EA e EM em bovinos, (2) investigar msRNAs microbianos e miRNAs hospedeiros, e procurar por potenciais interações com base na regulação de sRNA, (3) identificar moléculas de sRNA transportadas por EVs e investigar o impacto de msRNAs candidatos em células do rúmen de bovinos cultivadas in vitro e, (4) identificar sRNAs e miRNAs candidatos no conteúdo ruminal, sangue e saliva como biomarcadores para os fenótipos de interesse. (AU)

Publicações científicas

(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)

NICIURA, SIMONE CRISTINA MEO; CARDOSO, TAINA FIGUEIREDO; IBELLI, ADRIANA MERCIA GUARATINI; OKINO, CINTIA HIROMI; ANDRADE, BRUNO GABRIEL; BENAVIDES, MAGDA VIEIRA; CHAGAS, ANA CAROLINA DE SOUZA; ESTEVES, SERGIO NOVITA; MINHO, ALESSANDRO PELEGRINE; REGITANO, LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA; et al. . PARASITES & VECTORS, v. 17, n. 1, p. 19-pg., 2024-03-01. (21/02535-5, 19/02929-3, 21/11842-9, 22/06281-0, 17/01626-1)

BRUSCADIN, JENNIFER JESSICA; CARDOSO, TAINA FIGUEIREDO; CONTEVILLE, LILIANE COSTA; DA SILVA, JULIANA VIRGINIO; IBELLI, ADRIANA MERCIA GUARATINI; PENA, GABRIEL ALEXANDER COLMENAREZ; PORTO, THANNY; DE OLIVEIRA, PRISCILA SILVA NEUBERN; ANDRADE, BRUNO GABRIEL NASCIMENTO; ZERLOTINI, ADHEMAR; et al. . BMC Bioinformatics, v. 26, n. 1, p. 16-pg., 2025-10-01. (19/04089-2, 22/06281-0)

CARDOSO, TAINA FIGUEIREDO; BRUSCADIN, JENNIFER JESSICA; AFONSO, JULIANA; CONTEVILLE, LILIANE COSTA; ANDRADE, BRUNO GABRIEL NASCIMENTO; MALHEIROS, JESSICA MORAES; FERNANDES, ANNA CAROLINA; DINIZ, WELLISON J. S.; BANERJEE, PRIYANKA; DE OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; et al. . Mammalian Genome, v. N/A, p. 20-pg., 2025-09-25. (18/11953-2, 12/23638-8, 23/10717-1, 19/04089-2, 22/06281-0)