Da epigenética, variabilidade genômica e regulação da expressão gênica em Leishmania

• Processo: 23/03015-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2029
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Angela Kaysel Cruz
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: Ribeirão Preto
• Pesquisadores principais: Luiz Ricardo Orsini Tosi
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/10129-5 - EMU concedido no processo 2023/03015-0: citômetro de fluxo Cytoflex Base-Beckman, AP.EMU
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/09918-8 - Caracterização funcional do lncRNA52 em sua interação com LbrISWI em Leishmania braziliensis, BP.MS; 25/15819-2 - Geração e caracterização fenotípica de mutantes de Leishmania para estudos da plasticidade genômica sob stress replicativo, BP.TT; 25/09797-6 - A quinase ATM participa da modulação da plasticidade do genoma em Leishmania?, BP.PD; + mais bolsas vinculadas 25/05210-0 - Papel dual de ncRNAs associados a R-loops em resposta ao estresse replicativo e na regulação da expressão gênica em L. major, BP.MS; 24/18411-1 - Avaliação da participação de ncRNAs na formação de R-loops e seu papel na regulação da expressão gênica e interação parasito-hospedeiro em L. braziliensis, BP.PD; 24/20016-3 - Lupus La: caracterização e análise funcional da proteína em Leishmania braziliensis, BP.IC; 24/09219-0 - ncRNAs:investigando funções e biogênese, BP.PD; 24/07588-8 - Geração e caracterização fenotípica de mutantes de Leishmania para estudos da plasticidade genômica sob stress replicativo, BP.TT; 24/09300-1 - Modelagem de bancos de dados e adequação de analises em bioinformática de processos de regulação de expressão e variabilidade genômica em Leishmania., BP.TT; 24/07882-3 - Estabelecimento de abordagens inovadoras da investigação de interação proteína-proteína, proteína-RNA e DNA e RNA-RNA para o desenvolvimento ágil dos WP2 e WP3, BP.TT; 24/08412-0 - A quinase ATM participa da modulação da plasticidade do genoma em Leishmania?, BP.PD; 24/07364-2 - Caracterização funcional de Rad1 em Leishmania, uma subunidade do complexo de checkpoint 9-1-1, BP.DD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Biologia molecular Leishmania Expressão gênica Metilação Arginina RNA Epigenômica Variação genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Estresse replicativo | expressão gênica | leishmania | metilação de argininas | ncRNAs | Variabilidade genômica | Biologia Molecular de Leishmania

Resumo

O protozoário Leishmania, agente etiológico de doenças de importância médica indiscutível, possui formas peculiares de organização e expressão do seu genoma. O objetivo desta proposta é investigar elementos-chave da variabilidade genética e da regulação pós-transcricional da expressão gênica. Em linhas de investigação específicas estudaremos a variação do genoma em resposta ao estresse na replicação do DNA, a expressão e mecanismos de ação de RNAs não-codificadores e o papel de modificações pós-traducionais na interação do parasito com seus hospedeiros. Estes estudos usarão abordagens de ponta em biologia celular e molecular, tais como: edição genômica por CRISPR-Cas9; estratégias globais de análise e/ou prospecção como ChIP-seq e BioID; estudos de interação in-vivo RNA-RNA ou RNA-proteína; e ensaios de FISH de múltiplas cores. A proposta tem um forte componente de fortalecimento de intercâmbios, além de novas colaborações com laboratórios internacionais, reforçando a vocação dos laboratórios envolvidos para a colaboração internacional em rede. Assim, esta proposta espera representar avanços notáveis no campo da regulação de expressão por RNA e da compreensão da variabilidade genômica em tripanossomatídeos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BLACK, J. A.; POULTON, B. C.; GONZAGA, B.; ISKANTAR, A.; PAAPE, D.; TOSI, L. R. O.; MCCULLOCH, R.. AUK3 is required for faithful nuclear segregation in the bloodstream form of Trypanosoma brucei. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 261, p. 6-pg., 2025-01-08. (24/08412-0, 23/03015-0)