Identification and structure-function analysis of protein-protein interactions in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv citri

• Processo: 00/11573-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2001
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2006
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Shaker Chuck Farah
• Beneficiário: Shaker Chuck Farah
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 04/10916-3 - Estudo funcional dos fatores sigma de RNA polimerase do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri, BP.DD; 03/13201-2 - Identificação e análise funcional e estrutural de interações proteína-proteína do sistema de secreção do tipo III do Xanthomonas axonopodis pv citri, BP.DD; 03/13363-2 - Interações proteína-proteína em Xanthomonas: Chaperones de secreção tipo III, BP.TT; + mais bolsas vinculadas 03/01579-0 - Analise de interacoes proteina-proteina envolvendo fatores sigma de rna polimerase do fitopatogeno xanthomonas axonopodis pv. citris., BP.IC; 02/13811-2 - Interações proteína-proteína em Xanthomonas: chaperones de secreção tipo III, BP.TT; 01/13898-8 - Interações proteína-proteína em Xanthomonas: Chaperones de secreção tipo III, BP.DD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Genomas Análise de sequência de DNA Proteínas Fitopatologia Xanthomonas axonopodis Cancro (doença de planta) Xylella fastidiosa Clorose variegada dos citros
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Pathogenicity | Proteomics | Xylella Fastidiosa

Resumo

Neste projeto, nós propomos a identificação das interações proteína-proteína no patógeno de planta Xanthomonas axonopodis pv citri. 0 genoma deste patógeno foi recentemente sequenciado e as ORFs a serem utilizadas neste projeto são oriundas das bibliotecas clonadas em pUC e M 13 utilizadas para este sequenciamento. Estas ORFs serão clonadas em sistema two~hybrid de levedura. Inicialmente, vamos identificar as ínterações envolvendo proteínas codificadas pelos genes associados à patogenicidade, genes do sistema secretário do tipo 111, genes dos chaperones envolvidos neste sistema e genes de função ainda desconhecida. Nesta última categoria, se encontram aproximadamente 110 ORFs encontradas tanto em Xanthomonas axonopodis pv citri quanto no também fitopatógeno Xylella fastidiosa (Simpson et al., 2000), mas que não foram encontradas em outros organismos. Pretendemos ainda expandir nosso estudo para outras ORFs não abrangidas nas quatro categorias assinaladas acima. Aos resultados obtidos pelo nosso projeto, serão adicionados resultados de projetos paralelos envolvendo Xanthomonas axonopodis pv citri, como knock-outs de genes e trasncriptoma. A análise das interações proteína-proteína levarão ao estudo da estrutura e função de proteínas de interesse por métodos bioquímicos e espectroscópicos. (AU)